RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 IGF1RP08069 1367 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 BCRP11274 1271 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 GPC1P35052 558 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 DBN1Q16643 649 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 ACDQ96AP0 544 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 PODNQ7Z5L7 613 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 TRIM52Q96A61 297 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 H7C1W4 665 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 GPR25O00155 361 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 WDR44Q5JSH3 913 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-202ENST00000558300 OIP5O43482 229 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 RHOQP17081 205 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC125Q86Z20 511 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 PNMA1Q8ND90 353 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 CYLDQ9NQC7 956 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 RAB15P59190 212 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 ERVK-9P63128 1117 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 A0A1W2PRU2 124 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 KRBA1A5PL33 1030 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 MX2P20592 715 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 NBPF15Q8N660 670 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 BAG6P46379 1132 aa8.28□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 CLN3Q13286 438 aa8.28□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.28□□□□□ -1.08
TMOD3-202ENST00000558300 AP1G2O75843 785 aa8.27□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 THBS1P07996 1170 aa8.27□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 MAP2K3P46734 347 aa8.27□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 POU4F2Q12837 409 aa8.27□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 USP17L8P0C7I0 530 aa8.26□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.25□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 MEN1O00255 615 aa8.25□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 F11P03951 625 aa8.25□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 COL8A1P27658 744 aa8.25□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.25□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 Q8N3U1 123 aa8.25□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.25□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 TRAK2O60296 914 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 ZBBXA8MT70 800 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 KLRG1Q96E93 195 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-202ENST00000558300 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 NLRP3Q96P20 1036 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 RNF20Q5VTR2 975 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 RFC5P40937 340 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 FBXO45P0C2W1 286 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 SCTRP47872 440 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-202ENST00000558300 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.18□□□□□ -1.1
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