RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554184.5

CCNB1IP1-210, Transcript of cyclin B1 interacting protein 1, human

TSL 3

Gene CCNB1IP1, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HPS1	Q92902	700 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	STK17A	Q9UEE5	414 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RASA1	P20936	1047 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	STK32A	Q8WU08	396 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LILRA1	O75019	489 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	WFS1	O76024	890 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AVP	P01185	164 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ERVK-9	P63128	1117 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP4	Q13107	963 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRIM52	Q96A61	297 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ITPKC	Q96DU7	683 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	UST	Q9Y2C2	406 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TIMP2	P16035	220 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SCTR	P47872	440 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PDE4C	Q08493	712 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PTK7	Q13308	1070 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AAAS	Q9NRG9	546 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP17L15	C9J2P7	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP17L10	C9JJH3	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP17L12	C9JPN9	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP17L11	C9JVI0	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP17L21	D6R901	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP17L18	D6R9N7	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP17L22	D6RA61	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP17L19	D6RCP7	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP17L20	D6RJB6	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CLDN10	P78369	228 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP17L24	Q0WX57	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EML3	Q32P44	896 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SIRT1	Q96EB6	747 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CYLD	Q9NQC7	956 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		Q6ZVU0	165 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLAIN2	Q9P270	581 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NOD1	Q9Y239	953 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM196B	A6NMK8	535 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DPYD	Q12882	1025 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CBLB	Q13191	982 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DACH1	Q9UI36	760 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LGR5	O75473	907 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BRD1	O95696	1058 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DKK1	O94907	266 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GTF2I	P78347	998 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRIM50	Q86XT4	487 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ADH1A	P07327	375 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LCE2C	Q5TA81	110 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MEIOB	Q8N635	442 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SFI1	A8K8P3	1242 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AXIN1	O15169	862 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	WIPF1	O43516	503 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SCNN1A	P37088	669 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ATP1A2	P50993	1020 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCDC102B	Q68D86	513 aa		7.17	□□□□□ -1.26

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