RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC184Q52MB2 194 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDSP2-207ENST00000551594 TNS2Q63HR2 1409 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDSP2-207ENST00000551594 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CTDSP2-207ENST00000551594 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CTDSP2-207ENST00000551594 KDRP35968 1356 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDSP2-207ENST00000551594 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CTDSP2-207ENST00000551594 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
CTDSP2-207ENST00000551594 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CTDSP2-207ENST00000551594 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDSP2-207ENST00000551594 EP400Q96L91 3159 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDSP2-207ENST00000551594 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CTDSP2-207ENST00000551594 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP2-207ENST00000551594 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP2-207ENST00000551594 SPG7Q9UQ90 795 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-207ENST00000551594 CYP27B1O15528 508 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 PRKAR2BP31323 418 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 FCHSD2O94868 740 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 MRS2Q9HD23 443 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 SBF2Q86WG5 1849 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDSP2-207ENST00000551594 PHKG2P15735 406 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 TRIM37O94972 964 aa25■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 BCL9O00512 1426 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 KCNQ2O43526 872 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 MIER1Q8N108 512 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 SOCS7O14512 581 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.95■■□□□ 1.59
CTDSP2-207ENST00000551594 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 NHSQ6T4R5 1651 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 NEFMP07197 916 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 ITGB4P16144 1822 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC125Q86Z20 511 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 DCAF5Q96JK2 942 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 LGR6Q9HBX8 967 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP2-207ENST00000551594 CCER2I3L3R5 266 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 APBA3O96018 575 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 RUNDC1Q96C34 613 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 BTAF1O14981 1849 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 MAP3K5Q99683 1374 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 NFE2L2Q16236 605 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 IL17REQ8NFR9 667 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 PIGBQ92521 554 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CTDSP2-207ENST00000551594 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 CABP4P57796 275 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 DCTN1Q14203 1278 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 NEUROD2Q15784 382 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 BAG6P46379 1132 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 RIPK4P57078 832 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 MCM10Q7L590 875 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 APAF1O14727 1248 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CTDSP2-207ENST00000551594 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms