RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538064.1

LRRK1-211, Transcript of leucine rich repeat kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene LRRK1, Length 493 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1-211ENST00000538064 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.63■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.63■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 NBPF4Q96M43 638 aa20.63■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.63■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 NCAPD2Q15021 1401 aa20.62■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.62■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.62■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.6■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 NSD2O96028 1365 aa20.59■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.58■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.58■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 STK32BQ9NY57 414 aa20.58■□□□□ 0.89
LRRK1-211ENST00000538064 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.57■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 SPON1Q9HCB6 807 aa20.57■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 ITGB4P16144 1822 aa20.56■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.55■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 SLC15A2Q16348 729 aa20.55■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.54■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.54■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 PANK3Q9H999 370 aa20.54■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 POLKQ9UBT6 870 aa20.53■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.52■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
LRRK1-211ENST00000538064 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.51■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 C5P01031 1676 aa20.51■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.5■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 ZNF827Q17R98 1081 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 CYP27B1O15528 508 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 ZBTB7AO95365 584 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 EYA1Q99502 592 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 AKT1S1Q96B36 256 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRK1-211ENST00000538064 PTGER2P43116 358 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 MTFR1LQ9H019 292 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 SPG7Q9UQ90 795 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 MORC1Q86VD1 984 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 PALLDQ8WX93 1383 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.4■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 C4BP0C0L5 1744 aa20.39■□□□□ 0.86
LRRK1-211ENST00000538064 KCNQ4P56696 695 aa20.39■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.38■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.37■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 PHKG2P15735 406 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 MAP3K5Q99683 1374 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 PIGBQ92521 554 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 KDRP35968 1356 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
LRRK1-211ENST00000538064 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 ARXQ96QS3 562 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.3■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.29■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 IL13P35225 146 aa20.29■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.29■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 SYT17Q9BSW7 474 aa20.29■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 POLD1P28340 1107 aa20.28■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
LRRK1-211ENST00000538064 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
LRRK1-211ENST00000538064 CHD4Q14839 1912 aa20.26■□□□□ 0.83
LRRK1-211ENST00000538064 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.26■□□□□ 0.83
LRRK1-211ENST00000538064 SIK1P57059 783 aa20.26■□□□□ 0.83
LRRK1-211ENST00000538064 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.26■□□□□ 0.83
LRRK1-211ENST00000538064 DCAF5Q96JK2 942 aa20.26■□□□□ 0.83
LRRK1-211ENST00000538064 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
LRRK1-211ENST00000538064 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRK1-211ENST00000538064 MTHFSP49914 203 aa20.25■□□□□ 0.83
LRRK1-211ENST00000538064 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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