RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 MEGF6O75095 1541 aa26.97■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 APAF1O14727 1248 aa26.97■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.96■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 SOCS7O14512 581 aa26.95■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 SPG7Q9UQ90 795 aa26.95■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.95■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 DISP2A7MBM2 1401 aa26.94■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 NFE2L2Q16236 605 aa26.94■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 NGEFQ8N5V2 710 aa26.94■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.93■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 ILDR2Q71H61 639 aa26.93■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 GLI3P10071 1580 aa26.92■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.91■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 RIPK4P57078 832 aa26.9■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 NEUROD2Q15784 382 aa26.9■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 EXOC5O00471 708 aa26.89■■□□□ 1.9
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
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TSTA3-215ENST00000532308 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.88■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
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TSTA3-215ENST00000532308 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.87■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.87■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.86■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 DDB1Q16531 1140 aa26.86■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.86■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.86■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.85■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC27Q2M243 656 aa26.85■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.85■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 A0A0G2JS52 829 aa26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 MYT1Q01538 1121 aa26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 MAP3K5Q99683 1374 aa26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 TNS2Q63HR2 1409 aa26.83■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
TSTA3-215ENST00000532308 LRRC37A3O60309 1634 aa26.83■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 PHKG2P15735 406 aa26.82■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 RXRBP28702 533 aa26.82■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 CYP27B1O15528 508 aa26.8■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.8■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 WWC1Q8IX03 1113 aa26.79■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.79■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.78■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 PDE3BQ13370 1112 aa26.77■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 POTEAQ6S8J7 498 aa26.77■■□□□ 1.88
TSTA3-215ENST00000532308 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 WDR63Q8IWG1 891 aa26.75■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 DCAF5Q96JK2 942 aa26.75■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.75■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.74■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 MCM10Q7L590 875 aa26.74■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF521Q96K83 1311 aa26.73■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 DCTN1Q14203 1278 aa26.73■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 IL17REQ8NFR9 667 aa26.73■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.73■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 LGR6Q9HBX8 967 aa26.71■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.7■■□□□ 1.87
TSTA3-215ENST00000532308 GOLGA2Q08379 1002 aa26.7■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.7■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 IL16Q14005 1332 aa26.69■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 TEFQ10587 303 aa26.68■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.67■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.66■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.66■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 CABP4P57796 275 aa26.64■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 GNAI1P63096 354 aa26.64■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.64■■□□□ 1.86
TSTA3-215ENST00000532308 RGS12O14924 1447 aa26.64■■□□□ 1.85
TSTA3-215ENST00000532308 E9PSI1 815 aa26.63■■□□□ 1.85
TSTA3-215ENST00000532308 IFT57Q9NWB7 429 aa26.63■■□□□ 1.85
TSTA3-215ENST00000532308 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
TSTA3-215ENST00000532308 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
TSTA3-215ENST00000532308 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.62■■□□□ 1.85
TSTA3-215ENST00000532308 CFAP44Q96MT7 982 aa26.62■■□□□ 1.85
TSTA3-215ENST00000532308 ITGB4P16144 1822 aa26.62■■□□□ 1.85
TSTA3-215ENST00000532308 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.62■■□□□ 1.85
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