RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531920.6

MED17-208, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 3

Gene MED17, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-208	ENST00000531920	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	NR1H3	Q13133	447 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	LYPD8	Q6UX82	237 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	PIK3CD	O00329	1044 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	MAN1A2	O60476	641 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	ADAM23	O75077	832 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	DESI1	Q6ICB0	168 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	KANK3	Q6NY19	840 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	ZBBX	A8MT70	800 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	CCDC27	Q2M243	656 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	WHAMM	Q8TF30	809 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	BAP1	Q92560	729 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	SLURP2	P0DP57	97 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	SKI	P12755	728 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	CTH	P32929	405 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MED17-208	ENST00000531920	PTPRN	Q16849	979 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	7.52	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	MAP10	Q9P2G4	905 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	USP17L3	A6NCW0	530 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	USP17L4	A6NCW7	530 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	STK32A	Q8WU08	396 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	CDK15	Q96Q40	435 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	USP17L5	A8MUK1	530 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	ZNF511	Q8NB15	262 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	ITGB2	P05107	769 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	LINC01559	Q495D7	138 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	SVOP	Q8N4V2	548 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	ITPKC	Q96DU7	683 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	KCNH2	Q12809	1159 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
MED17-208	ENST00000531920	USP17L15	C9J2P7	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	USP17L10	C9JJH3	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	USP17L12	C9JPN9	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	USP17L11	C9JVI0	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	USP17L21	D6R901	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	USP17L18	D6R9N7	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	USP17L22	D6RA61	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	USP17L19	D6RCP7	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	USP17L20	D6RJB6	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920		E9PSI1	815 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	NR3C2	P08235	984 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	USP17L24	Q0WX57	530 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	MSTN	O14793	375 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	BMP2	P12643	396 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	RASA1	P20936	1047 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	GRM5	P41594	1212 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	NCOA4	Q13772	614 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	MEIOB	Q8N635	442 aa		7.45	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	FAM196B	A6NMK8	535 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	PTS	Q03393	145 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	PTK2	Q05397	1052 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	NR5A1	Q13285	461 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	RNF135	Q8IUD6	432 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	PTK7	Q13308	1070 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	AGER	Q15109	404 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MED17-208	ENST00000531920	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		7.43	□□□□□ -1.22

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