RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 RNF217Q8TC41 542 aa7.66□□□□□ -1.18
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
HDAC2-216ENST00000523628 ESPNB1AK53 854 aa7.65□□□□□ -1.18
HDAC2-216ENST00000523628 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.65□□□□□ -1.18
HDAC2-216ENST00000523628 LILRA1O75019 489 aa7.65□□□□□ -1.18
HDAC2-216ENST00000523628 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
HDAC2-216ENST00000523628 RAB15P59190 212 aa7.65□□□□□ -1.18
HDAC2-216ENST00000523628 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
HDAC2-216ENST00000523628 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 SV2AQ7L0J3 742 aa7.64□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.64□□□□□ -1.19
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HDAC2-216ENST00000523628 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.63□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 C14orf37Q86TY3 774 aa7.63□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 PRDM2Q13029 1718 aa7.63□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.62□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.62□□□□□ -1.19
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HDAC2-216ENST00000523628 GSK3AP49840 483 aa7.62□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.62□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.62□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.62□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 WDR62O43379 1518 aa7.62□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.62□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.61□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM52Q96A61 297 aa7.61□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 ABCC8Q09428 1581 aa7.6□□□□□ -1.19
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HDAC2-216ENST00000523628 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.6□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 CFTRP13569 1480 aa7.6□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 SVOPQ8N4V2 548 aa7.59□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 CYLDQ9NQC7 956 aa7.59□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 WIZO95785 1651 aa7.59□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.59□□□□□ -1.19
HDAC2-216ENST00000523628 ZBBXA8MT70 800 aa7.58□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 WHAMMQ8TF30 809 aa7.58□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 NESP48681 1621 aa7.58□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF15O94989 841 aa7.57□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 RASSF7Q02833 373 aa7.57□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC125Q86Z20 511 aa7.57□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.57□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.57□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.56□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 SNRKQ9NRH2 765 aa7.56□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.56□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.55□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 GDF11O95390 407 aa7.55□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 FBXO45P0C2W1 286 aa7.55□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 MCM6Q14566 821 aa7.55□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.55□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTS2O95450 1211 aa7.54□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 RHOQP17081 205 aa7.54□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 GPC1P35052 558 aa7.54□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 POM121Q96HA1 1249 aa7.54□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 ERVK-9P63128 1117 aa7.53□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 RNF20Q5VTR2 975 aa7.53□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.53□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.53□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 GMCL1Q96IK5 515 aa7.53□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 WDR97A6NE52 1622 aa7.52□□□□□ -1.2
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PRU2 124 aa7.52□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 MEN1O00255 615 aa7.52□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 GAS6Q14393 721 aa7.52□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.52□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 ZMYND15Q9H091 742 aa7.52□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 NR1H3Q13133 447 aa7.51□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.51□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.51□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF592Q92610 1267 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 SOCS7O14512 581 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 IRS1P35568 1242 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 MAP3K10Q02779 954 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 FLIIQ13045 1269 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 DBN1Q16643 649 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 BANK1Q8NDB2 785 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 NLRP3Q96P20 1036 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 MBIPQ9NS73 344 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HDAC2-216ENST00000523628 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.49□□□□□ -1.21
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