RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523456.1

PDGFRB-211, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 2

Gene PDGFRB, Length 1,023 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-211ENST00000523456 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 MTFR1LQ9H019 292 aa15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 MEGF6O75095 1541 aa15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.47■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 PTGER2P43116 358 aa15.47■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.47■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa15.46■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 NCAPD2Q15021 1401 aa15.46■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.46■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 CCER2I3L3R5 266 aa15.46■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 ANP32CO43423 234 aa15.46■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.46■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 NBPF4Q96M43 638 aa15.46■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.46■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 NSD2O96028 1365 aa15.46■□□□□ 0.07
PDGFRB-211ENST00000523456 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.45■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 FBLN1P23142 703 aa15.45■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.45■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa15.45■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.45■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 LY75O60449 1722 aa15.44■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.44■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.44■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.44■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 AKT1S1Q96B36 256 aa15.44■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.44■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 MAP3K5Q99683 1374 aa15.44■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 CEP350Q5VT06 3117 aa15.43■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 ZBTB7AO95365 584 aa15.43■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.43■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.43■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.42■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.42■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.42■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 C1QTNF8P60827 252 aa15.41■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 ZNF827Q17R98 1081 aa15.41■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.4■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.4■□□□□ 0.06
PDGFRB-211ENST00000523456 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 ARXQ96QS3 562 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 SYT17Q9BSW7 474 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 CYP27B1O15528 508 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 POLKQ9UBT6 870 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.34■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.34■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 SPG7Q9UQ90 795 aa15.34■□□□□ 0.05
PDGFRB-211ENST00000523456 POLD1P28340 1107 aa15.33■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 C5P01031 1676 aa15.32■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 FLAD1Q8NFF5 587 aa15.32■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 EYA1Q99502 592 aa15.32■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 PALLDQ8WX93 1383 aa15.32■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.31■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 ITGB4P16144 1822 aa15.3■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.3■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.29■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.29■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 PANK3Q9H999 370 aa15.29■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 KCNQ4P56696 695 aa15.28■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.28■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 IFNL2Q8IZJ0 200 aa15.28■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 PHKG2P15735 406 aa15.27■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 PIGBQ92521 554 aa15.27■□□□□ 0.04
PDGFRB-211ENST00000523456 C4BP0C0L5 1744 aa15.26■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.25■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 CHD4Q14839 1912 aa15.25■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.24■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.24■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.23■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.23■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 SIK1P57059 783 aa15.23■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.23■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 KDRP35968 1356 aa15.23■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.23■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 SSFA2P28290 1259 aa15.22■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 MORC1Q86VD1 984 aa15.22■□□□□ 0.03
PDGFRB-211ENST00000523456 DCAF5Q96JK2 942 aa15.22■□□□□ 0.03
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