RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-210ENST00000512194 C3P01024 1663 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-210ENST00000512194 NR1H3Q13133 447 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-210ENST00000512194 MLECQ14165 292 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-210ENST00000512194 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-210ENST00000512194 SLC6A16Q9GZN6 736 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-210ENST00000512194 ZBBXA8MT70 800 aa11.02□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 ZNF516Q92618 1163 aa11.02□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.02□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.01□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 GPSM3Q9Y4H4 160 aa11.01□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.01□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 SEMA3FQ13275 785 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 PDXDC2PQ6P474 469 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 NBPF14Q5TI25 921 aa10.99□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 HCSTQ9UBK5 93 aa10.99□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 FBXO45P0C2W1 286 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 C9orf84Q5VXU9 1444 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 TIAM1Q13009 1591 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 ABCA6Q8N139 1617 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 PTK2Q05397 1052 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 ZNF592Q92610 1267 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 ATP10AO60312 1499 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 KDM5CP41229 1560 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 PTPRTO14522 1441 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 SCAPERQ9BY12 1400 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-210ENST00000512194 KIF14Q15058 1648 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 S1PR4O95977 384 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 KCNC4Q03721 635 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 REREQ9P2R6 1566 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 PLCH2O75038 1416 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 NCOA1Q15788 1441 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 SPNS2Q8IVW8 549 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 UCN2Q96RP3 112 aa10.91□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa10.9□□□□□ -0.66
HERC3-210ENST00000512194 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 PBXIP1Q96AQ6 731 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.89□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.88□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.88□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 MROH2AA6NES4 1674 aa10.88□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 GGCXP38435 758 aa10.87□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 ZBTB33Q86T24 672 aa10.87□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 PCGF6Q9BYE7 350 aa10.87□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.87□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.87□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 AGLP35573 1532 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 ATP9BO43861 1147 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 ADAM32Q8TC27 787 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 BAP1Q92560 729 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 NCOA2Q15596 1464 aa10.86□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 RFX1P22670 979 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 ZNF511Q8NB15 262 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.85□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.84□□□□□ -0.67
HERC3-210ENST00000512194 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms