RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512152.5

TAF9-208, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 9, human

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene TAF9, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF9-208	ENST00000512152	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
TAF9-208	ENST00000512152	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.02	■■■□□ 2.08
TAF9-208	ENST00000512152	USP35	Q9P2H5	1018 aa		28.02	■■■□□ 2.08
TAF9-208	ENST00000512152	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
TAF9-208	ENST00000512152	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
TAF9-208	ENST00000512152	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.01	■■■□□ 2.07
TAF9-208	ENST00000512152	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		28	■■■□□ 2.07
TAF9-208	ENST00000512152	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
TAF9-208	ENST00000512152	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TAF9-208	ENST00000512152	NEFM	P07197	916 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TAF9-208	ENST00000512152	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TAF9-208	ENST00000512152	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TAF9-208	ENST00000512152	TNS2	Q63HR2	1409 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TAF9-208	ENST00000512152	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TAF9-208	ENST00000512152	SPG7	Q9UQ90	795 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TAF9-208	ENST00000512152	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	NGEF	Q8N5V2	710 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	POTEA	Q6S8J7	498 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	RXRB	P28702	533 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	LRRC37A3	O60309	1634 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	NFE2L2	Q16236	605 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	EXOC5	O00471	708 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	APAF1	O14727	1248 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	DDB1	Q16531	1140 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TAF9-208	ENST00000512152	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	CYP27B1	O15528	508 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	PHKG2	P15735	406 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	CCDC27	Q2M243	656 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	MAP3K5	Q99683	1374 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	BCL9	O00512	1426 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TAF9-208	ENST00000512152	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	RIPK4	P57078	832 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	RGS12	O14924	1447 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	PDE3B	Q13370	1112 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	DCAF5	Q96JK2	942 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152		A0A0G2JS52	829 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	MYT1	Q01538	1121 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.04
TAF9-208	ENST00000512152	ZNF521	Q96K83	1311 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	WWC1	Q8IX03	1113 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	MRC1	P22897	1456 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	27.73	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	NEUROD2	Q15784	382 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TAF9-208	ENST00000512152	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
TAF9-208	ENST00000512152	WDR63	Q8IWG1	891 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TAF9-208	ENST00000512152	LGR6	Q9HBX8	967 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TAF9-208	ENST00000512152	IL16	Q14005	1332 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TAF9-208	ENST00000512152	MCM10	Q7L590	875 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TAF9-208	ENST00000512152	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TAF9-208	ENST00000512152	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TAF9-208	ENST00000512152	DCTN1	Q14203	1278 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TAF9-208	ENST00000512152	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TAF9-208	ENST00000512152	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TAF9-208	ENST00000512152	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TAF9-208	ENST00000512152	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	ZNF853	P0CG23	659 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	TEF	Q10587	303 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	IFT57	Q9NWB7	429 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	NHS	Q6T4R5	1651 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	CABP4	P57796	275 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	CFAP44	Q96MT7	982 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	CHL1	O00533	1208 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	GOLGA2	Q08379	1002 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TAF9-208	ENST00000512152	ITGB4	P16144	1822 aa		27.59	■■■□□ 2.01

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