RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 RREB1Q92766 1687 aa26.85■■□□□ 1.89
SMIM20-201ENST00000506197 ERBB3P21860 1342 aa26.85■■□□□ 1.89
SMIM20-201ENST00000506197 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SMIM20-201ENST00000506197 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SMIM20-201ENST00000506197 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SMIM20-201ENST00000506197 IL13P35225 146 aa26.82■■□□□ 1.88
SMIM20-201ENST00000506197 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.82■■□□□ 1.88
SMIM20-201ENST00000506197 LRP5O75197 1615 aa26.82■■□□□ 1.88
SMIM20-201ENST00000506197 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SMIM20-201ENST00000506197 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
SMIM20-201ENST00000506197 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.81■■□□□ 1.88
SMIM20-201ENST00000506197 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.78■■□□□ 1.88
SMIM20-201ENST00000506197 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SMIM20-201ENST00000506197 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.77■■□□□ 1.88
SMIM20-201ENST00000506197 TNS2Q63HR2 1409 aa26.75■■□□□ 1.87
SMIM20-201ENST00000506197 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SMIM20-201ENST00000506197 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
SMIM20-201ENST00000506197 EYA1Q99502 592 aa26.75■■□□□ 1.87
SMIM20-201ENST00000506197 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.74■■□□□ 1.87
SMIM20-201ENST00000506197 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.74■■□□□ 1.87
SMIM20-201ENST00000506197 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SMIM20-201ENST00000506197 NBPF4Q96M43 638 aa26.74■■□□□ 1.87
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SMIM20-201ENST00000506197 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SMIM20-201ENST00000506197 BCL9O00512 1426 aa26.73■■□□□ 1.87
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SMIM20-201ENST00000506197 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.71■■□□□ 1.87
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SMIM20-201ENST00000506197 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.7■■□□□ 1.86
SMIM20-201ENST00000506197 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.7■■□□□ 1.86
SMIM20-201ENST00000506197 NCAPD2Q15021 1401 aa26.69■■□□□ 1.86
SMIM20-201ENST00000506197 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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SMIM20-201ENST00000506197 KDRP35968 1356 aa26.67■■□□□ 1.86
SMIM20-201ENST00000506197 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.66■■□□□ 1.86
SMIM20-201ENST00000506197 FCHSD2O94868 740 aa26.65■■□□□ 1.86
SMIM20-201ENST00000506197 NHSQ6T4R5 1651 aa26.65■■□□□ 1.86
SMIM20-201ENST00000506197 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.64■■□□□ 1.86
SMIM20-201ENST00000506197 NBPF14Q5TI25 921 aa26.64■■□□□ 1.86
SMIM20-201ENST00000506197 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.64■■□□□ 1.86
SMIM20-201ENST00000506197 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.64■■□□□ 1.86
SMIM20-201ENST00000506197 PLSCR1O15162 318 aa26.63■■□□□ 1.85
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SMIM20-201ENST00000506197 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.63■■□□□ 1.85
SMIM20-201ENST00000506197 PRKAR2BP31323 418 aa26.62■■□□□ 1.85
SMIM20-201ENST00000506197 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SMIM20-201ENST00000506197 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.6■■□□□ 1.85
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SMIM20-201ENST00000506197 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.57■■□□□ 1.84
SMIM20-201ENST00000506197 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.56■■□□□ 1.84
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SMIM20-201ENST00000506197 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.54■■□□□ 1.84
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SMIM20-201ENST00000506197 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.51■■□□□ 1.83
SMIM20-201ENST00000506197 PROM2Q8N271 834 aa26.51■■□□□ 1.83
SMIM20-201ENST00000506197 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.5■■□□□ 1.83
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SMIM20-201ENST00000506197 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.49■■□□□ 1.83
SMIM20-201ENST00000506197 TXNRD1Q16881 649 aa26.49■■□□□ 1.83
SMIM20-201ENST00000506197 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.49■■□□□ 1.83
SMIM20-201ENST00000506197 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SMIM20-201ENST00000506197 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SMIM20-201ENST00000506197 APAF1O14727 1248 aa26.46■■□□□ 1.83
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SMIM20-201ENST00000506197 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.44■■□□□ 1.82
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SMIM20-201ENST00000506197 SPON1Q9HCB6 807 aa26.42■■□□□ 1.82
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SMIM20-201ENST00000506197 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.4■■□□□ 1.82
SMIM20-201ENST00000506197 MAP3K5Q99683 1374 aa26.4■■□□□ 1.82
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SMIM20-201ENST00000506197 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.38■■□□□ 1.81
SMIM20-201ENST00000506197 PHKG2P15735 406 aa26.38■■□□□ 1.81
SMIM20-201ENST00000506197 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
SMIM20-201ENST00000506197 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.38■■□□□ 1.81
SMIM20-201ENST00000506197 CYP27B1O15528 508 aa26.37■■□□□ 1.81
SMIM20-201ENST00000506197 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SMIM20-201ENST00000506197 SLC15A2Q16348 729 aa26.37■■□□□ 1.81
SMIM20-201ENST00000506197 NGEFQ8N5V2 710 aa26.37■■□□□ 1.81
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