RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 BARGINQ6ZT62 677 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa17.96■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 RGPD2P0DJD1 1756 aa17.95■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 IL2RBP14784 551 aa17.95■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 EYA1Q99502 592 aa17.95■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 NUDCQ9Y266 331 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 IL13P35225 146 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 PDE3BQ13370 1112 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 DDB1Q16531 1140 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 LRP5O75197 1615 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 TATP17735 454 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 HMOX1P09601 288 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 SULT6B1Q6IMI4 303 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 EXOC5O00471 708 aa17.9■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 CAMKK2Q96RR4 588 aa17.9■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 IGSF1Q8N6C5 1336 aa17.9■□□□□ 0.46
PGGT1B-204ENST00000503638 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 WNK3Q9BYP7 1800 aa17.89■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TRIM37O94972 964 aa17.89■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 AEBP1Q8IUX7 1158 aa17.89■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa17.89■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 MEGF6O75095 1541 aa17.88■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.87■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 DISP2A7MBM2 1401 aa17.87■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRC37A3O60309 1634 aa17.87■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TNS2Q63HR2 1409 aa17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa17.85■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM196AQ6ZSG2 479 aa17.85■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 MRS2Q9HD23 443 aa17.85■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SPG7Q9UQ90 795 aa17.85■□□□□ 0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 APBA3O96018 575 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 NEFMP07197 916 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 RGPD1P0DJD0 1748 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 NCAPD2Q15021 1401 aa17.82■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa17.82■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa17.82■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 PRKAR2BP31323 418 aa17.82■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 KDRP35968 1356 aa17.8■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 AMOTQ4VCS5 1084 aa17.79■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf141Q5JVX7 400 aa17.79■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.78■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC184Q52MB2 194 aa17.78■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 RSPH6AQ9H0K4 717 aa17.78■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 FCHSD2O94868 740 aa17.77■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 IFNL2Q8IZJ0 200 aa17.76■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 ACSBG1Q96GR2 724 aa17.76■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.75■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 PKD1L3Q7Z443 1732 aa17.75■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 CYP27B1O15528 508 aa17.74■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAMTS8Q9UP79 889 aa17.74■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 PHKG2P15735 406 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 MIER1Q8N108 512 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 GAS2L2Q8NHY3 880 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 PHACTR3Q96KR7 559 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 SHANK3Q9BYB0 1731 aa17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 PTF1AQ7RTS3 328 aa17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-204ENST00000503638 AKAP4Q5JQC9 854 aa17.7■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa17.7■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 KAT6BQ8WYB5 2073 aa17.69■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 NBPF14Q5TI25 921 aa17.69■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP3K5Q99683 1374 aa17.68■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 RREB1Q92766 1687 aa17.68■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 GNAT3A8MTJ3 354 aa17.68■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNQ2O43526 872 aa17.68■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 DOT1LQ8TEK3 1739 aa17.68■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 RUNDC1Q96C34 613 aa17.68■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 DCAF5Q96JK2 942 aa17.68■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 CCER2I3L3R5 266 aa17.67■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 CABP4P57796 275 aa17.67■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 NEUROD2Q15784 382 aa17.67■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.67■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 NUP188Q5SRE5 1749 aa17.67■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHF1Q96S99 279 aa17.66■□□□□ 0.42
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