RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498183.5

GRAMD1C-215, Transcript of GRAM domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene GRAMD1C, Length 735 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1C-215ENST00000498183 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.51■■■□□ 2.31
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GRAMD1C-215ENST00000498183 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.49■■■□□ 2.31
GRAMD1C-215ENST00000498183 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.49■■■□□ 2.31
GRAMD1C-215ENST00000498183 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.49■■■□□ 2.31
GRAMD1C-215ENST00000498183 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
GRAMD1C-215ENST00000498183 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.48■■■□□ 2.31
GRAMD1C-215ENST00000498183 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
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GRAMD1C-215ENST00000498183 EXOC5O00471 708 aa29.44■■■□□ 2.3
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GRAMD1C-215ENST00000498183 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
GRAMD1C-215ENST00000498183 LRRC37A3O60309 1634 aa29.44■■■□□ 2.3
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GRAMD1C-215ENST00000498183 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.42■■■□□ 2.3
GRAMD1C-215ENST00000498183 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.41■■■□□ 2.3
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GRAMD1C-215ENST00000498183 SPG7Q9UQ90 795 aa29.41■■■□□ 2.3
GRAMD1C-215ENST00000498183 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.4■■■□□ 2.3
GRAMD1C-215ENST00000498183 TNS2Q63HR2 1409 aa29.4■■■□□ 2.3
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GRAMD1C-215ENST00000498183 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.39■■■□□ 2.3
GRAMD1C-215ENST00000498183 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.3
GRAMD1C-215ENST00000498183 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.39■■■□□ 2.3
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GRAMD1C-215ENST00000498183 CYP27B1O15528 508 aa29.37■■■□□ 2.29
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GRAMD1C-215ENST00000498183 PDE3BQ13370 1112 aa29.36■■■□□ 2.29
GRAMD1C-215ENST00000498183 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
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GRAMD1C-215ENST00000498183 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.35■■■□□ 2.29
GRAMD1C-215ENST00000498183 APAF1O14727 1248 aa29.34■■■□□ 2.29
GRAMD1C-215ENST00000498183 PHKG2P15735 406 aa29.34■■■□□ 2.29
GRAMD1C-215ENST00000498183 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.34■■■□□ 2.29
GRAMD1C-215ENST00000498183 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.34■■■□□ 2.29
GRAMD1C-215ENST00000498183 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.34■■■□□ 2.29
GRAMD1C-215ENST00000498183 NFE2L2Q16236 605 aa29.32■■■□□ 2.28
GRAMD1C-215ENST00000498183 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.32■■■□□ 2.28
GRAMD1C-215ENST00000498183 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.32■■■□□ 2.28
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GRAMD1C-215ENST00000498183 NEUROD2Q15784 382 aa29.3■■■□□ 2.28
GRAMD1C-215ENST00000498183 C1orf141Q5JVX7 400 aa29.3■■■□□ 2.28
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GRAMD1C-215ENST00000498183 RIPK4P57078 832 aa29.27■■■□□ 2.28
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GRAMD1C-215ENST00000498183 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.26■■■□□ 2.27
GRAMD1C-215ENST00000498183 MAP3K5Q99683 1374 aa29.26■■■□□ 2.27
GRAMD1C-215ENST00000498183 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.25■■■□□ 2.27
GRAMD1C-215ENST00000498183 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
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GRAMD1C-215ENST00000498183 DCTN1Q14203 1278 aa29.23■■■□□ 2.27
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GRAMD1C-215ENST00000498183 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.21■■■□□ 2.27
GRAMD1C-215ENST00000498183 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.21■■■□□ 2.27
GRAMD1C-215ENST00000498183 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
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GRAMD1C-215ENST00000498183 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
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GRAMD1C-215ENST00000498183 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.16■■■□□ 2.26
GRAMD1C-215ENST00000498183 SCN11AQ9UI33 1791 aa29.16■■■□□ 2.26
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GRAMD1C-215ENST00000498183 TEFQ10587 303 aa29.08■■■□□ 2.25
GRAMD1C-215ENST00000498183 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
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GRAMD1C-215ENST00000498183 NHSQ6T4R5 1651 aa29.06■■■□□ 2.24
GRAMD1C-215ENST00000498183 MRC1P22897 1456 aa29.06■■■□□ 2.24
GRAMD1C-215ENST00000498183 TMOD3Q9NYL9 352 aa29.06■■■□□ 2.24
GRAMD1C-215ENST00000498183 NGEFQ8N5V2 710 aa29.04■■■□□ 2.24
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