RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 SGIP1Q9BQI5 828 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.8■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 MYOM1P52179 1685 aa30.8■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 KAT6BQ8WYB5 2073 aa30.8■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 MEGF6O75095 1541 aa30.79■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 INSRP06213 1382 aa30.79■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 AKT1S1Q96B36 256 aa30.78■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 SYT17Q9BSW7 474 aa30.78■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 SLC16A10Q8TF71 515 aa30.77■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 ARXQ96QS3 562 aa30.77■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 FLT4P35916 1363 aa30.77■■■□□ 2.52
PTPRN-215ENST00000484986 TATP17735 454 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
PTPRN-215ENST00000484986 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa30.75■■■□□ 2.51
PTPRN-215ENST00000484986 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.74■■■□□ 2.51
PTPRN-215ENST00000484986 USHBP1Q8N6Y0 703 aa30.74■■■□□ 2.51
PTPRN-215ENST00000484986 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa30.73■■■□□ 2.51
PTPRN-215ENST00000484986 NSD2O96028 1365 aa30.73■■■□□ 2.51
PTPRN-215ENST00000484986 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.72■■■□□ 2.51
PTPRN-215ENST00000484986 MAP3K5Q99683 1374 aa30.7■■■□□ 2.51
PTPRN-215ENST00000484986 RGPD2P0DJD1 1756 aa30.7■■■□□ 2.51
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PTPRN-215ENST00000484986 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
PTPRN-215ENST00000484986 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.7■■■□□ 2.5
PTPRN-215ENST00000484986 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa30.7■■■□□ 2.5
PTPRN-215ENST00000484986 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa30.7■■■□□ 2.5
PTPRN-215ENST00000484986 POLD1P28340 1107 aa30.69■■■□□ 2.5
PTPRN-215ENST00000484986 DOT1LQ8TEK3 1739 aa30.69■■■□□ 2.5
PTPRN-215ENST00000484986 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa30.69■■■□□ 2.5
PTPRN-215ENST00000484986 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.68■■■□□ 2.5
PTPRN-215ENST00000484986 SHANK3Q9BYB0 1731 aa30.67■■■□□ 2.5
PTPRN-215ENST00000484986 KCNQ4P56696 695 aa30.66■■■□□ 2.5
PTPRN-215ENST00000484986 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30.64■■■□□ 2.5
PTPRN-215ENST00000484986 QSER1Q2KHR3 1735 aa30.63■■■□□ 2.49
PTPRN-215ENST00000484986 UTRNP46939 3433 aa30.63■■■□□ 2.49
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PTPRN-215ENST00000484986 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.62■■■□□ 2.49
PTPRN-215ENST00000484986 LY75O60449 1722 aa30.61■■■□□ 2.49
PTPRN-215ENST00000484986 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.59■■■□□ 2.49
PTPRN-215ENST00000484986 CYP27B1O15528 508 aa30.58■■■□□ 2.49
PTPRN-215ENST00000484986 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa30.57■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 SPG7Q9UQ90 795 aa30.57■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 MSH5O43196 834 aa30.56■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 KLHL34Q8N239 644 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 NCAPD2Q15021 1401 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 PALLDQ8WX93 1383 aa30.54■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 GPR162Q16538 588 aa30.54■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.54■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 FLAD1Q8NFF5 587 aa30.53■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP30.53■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
PTPRN-215ENST00000484986 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.51■■■□□ 2.47
PTPRN-215ENST00000484986 POLKQ9UBT6 870 aa30.51■■■□□ 2.47
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
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PTPRN-215ENST00000484986 COL24A1Q17RW2 1714 aa30.5■■■□□ 2.47
PTPRN-215ENST00000484986 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.48■■■□□ 2.47
PTPRN-215ENST00000484986 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa30.48■■■□□ 2.47
PTPRN-215ENST00000484986 PKD1L3Q7Z443 1732 aa30.47■■■□□ 2.47
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PTPRN-215ENST00000484986 AK7Q96M32 723 aa30.44■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa30.43■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 C5P01031 1676 aa30.43■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 IFNL2Q8IZJ0 200 aa30.43■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 TMOD3Q9NYL9 352 aa30.43■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 NLGN2Q8NFZ4 835 aa30.41■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 PHKG2P15735 406 aa30.4■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 MSL1Q68DK7 614 aa30.4■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 PANK3Q9H999 370 aa30.4■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa30.39■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 CHD4Q14839 1912 aa30.39■■■□□ 2.46
PTPRN-215ENST00000484986 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.38■■■□□ 2.45
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PTPRN-215ENST00000484986 GRIN3BO60391 1043 aa30.37■■■□□ 2.45
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PTPRN-215ENST00000484986 ITGB4P16144 1822 aa30.36■■■□□ 2.45
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PTPRN-215ENST00000484986 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.34■■■□□ 2.45
PTPRN-215ENST00000484986 SSFA2P28290 1259 aa30.34■■■□□ 2.45
PTPRN-215ENST00000484986 TAF1LQ8IZX4 1826 aa30.33■■■□□ 2.45
PTPRN-215ENST00000484986 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
PTPRN-215ENST00000484986 ASAP1Q9ULH1 1129 aa30.33■■■□□ 2.45
PTPRN-215ENST00000484986 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
PTPRN-215ENST00000484986 PHF14O94880 888 aa30.31■■■□□ 2.44
PTPRN-215ENST00000484986 ATP6V1AP38606 617 aa30.3■■■□□ 2.44
PTPRN-215ENST00000484986 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
PTPRN-215ENST00000484986 MORC1Q86VD1 984 aa30.3■■■□□ 2.44
PTPRN-215ENST00000484986 LINC00116Q8NCU8 138 aa30.3■■■□□ 2.44
PTPRN-215ENST00000484986 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.29■■■□□ 2.44
PTPRN-215ENST00000484986 ATG3Q9NT62 314 aa30.29■■■□□ 2.44
PTPRN-215ENST00000484986 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.44
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