RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447577.5

CCDC18-AS1-216, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 431 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 EXOC5O00471 708 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SLIT3O75094 1523 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 GCP02774 474 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CREBZFQ9NS37 354 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 BCS1LQ9Y276 419 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ERBB3P21860 1342 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 VEGFBP49765 207 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NSD2O96028 1365 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ROCK1Q13464 1354 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 LTBP1Q14766 1721 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ABTB2Q8N961 1025 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RNF181Q9P0P0 153 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 C4BP0C0L5 1744 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 A0A0G2JLW4 131 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DLL1O00548 723 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 POGKQ9P215 609 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ADGRB1O14514 1584 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CCDC7Q96M83 1385 aa9.77□□□□□ -0.84
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SOX10P56693 466 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ACEP12821 1306 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.77□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 POTECB2RU33 542 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FCHSD2O94868 740 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.76□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 POTEIP0CG38 1075 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 POTEJP0CG39 1038 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RGL3Q3MIN7 710 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NLRP13Q86W25 1043 aa9.75□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DPEP1P16444 411 aa9.74□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TSKSQ9UJT2 592 aa9.74□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.73□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 C4AP0C0L4 1744 aa9.73□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 GLTPD2A6NH11 291 aa9.72□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PHF14O94880 888 aa9.72□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RASSF7Q02833 373 aa9.72□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PASKQ96RG2 1323 aa9.72□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NFAT5O94916 1531 aa9.72□□□□□ -0.85
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KCNA3P22001 575 aa9.71□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CHADLQ6NUI6 762 aa9.71□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DCAF5Q96JK2 942 aa9.71□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.71□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MMP10P09238 476 aa9.7□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 IL2RBP14784 551 aa9.7□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TGFB2P61812 414 aa9.7□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 LTN1O94822 1766 aa9.7□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.69□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.69□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.69□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NLRP6P59044 892 aa9.68□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DGKZQ13574 1117 aa9.68□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.67□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.67□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SOX12O15370 315 aa9.67□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 USP47Q96K76 1375 aa9.66□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.66□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa9.66□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RASSF10A6NK89 507 aa9.66□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 GCC1Q96CN9 775 aa9.66□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ITGB4P16144 1822 aa9.66□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 AK7Q96M32 723 aa9.65□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.65□□□□□ -0.86
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.65□□□□□ -0.87
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ITGAEP38570 1179 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CDK19Q9BWU1 502 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms