RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430390.5

TTLL3-211, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 1,674 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-211ENST00000430390 COL18A1P39060 1754 aa15.57■□□□□ 0.08
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TTLL3-211ENST00000430390 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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TTLL3-211ENST00000430390 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
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TTLL3-211ENST00000430390 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.41■□□□□ 0.06
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TTLL3-211ENST00000430390 CHL1O00533 1208 aa15.41■□□□□ 0.06
TTLL3-211ENST00000430390 DCTN1Q14203 1278 aa15.41■□□□□ 0.06
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TTLL3-211ENST00000430390 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa15.39■□□□□ 0.05
TTLL3-211ENST00000430390 PLIN1O60240 522 aa15.38■□□□□ 0.05
TTLL3-211ENST00000430390 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.38■□□□□ 0.05
TTLL3-211ENST00000430390 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.38■□□□□ 0.05
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TTLL3-211ENST00000430390 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.38■□□□□ 0.05
TTLL3-211ENST00000430390 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
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TTLL3-211ENST00000430390 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TTLL3-211ENST00000430390 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TTLL3-211ENST00000430390 MEGF6O75095 1541 aa15.36■□□□□ 0.05
TTLL3-211ENST00000430390 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TTLL3-211ENST00000430390 DDB1Q16531 1140 aa15.35■□□□□ 0.05
TTLL3-211ENST00000430390 C1orf141Q5JVX7 400 aa15.35■□□□□ 0.05
TTLL3-211ENST00000430390 IL17REQ8NFR9 667 aa15.35■□□□□ 0.05
TTLL3-211ENST00000430390 VAMP4O75379 141 aa15.35■□□□□ 0.05
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