RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BTAF1O14981 1849 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AKT1S1Q96B36 256 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MEGF6O75095 1541 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PAPPAQ13219 1627 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NSD2O96028 1365 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SYT17Q9BSW7 474 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF827Q17R98 1081 aa21.32■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.32■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MAP3K5Q99683 1374 aa21.31■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MYOM1P52179 1685 aa21.31■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.3■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARXQ96QS3 562 aa21.3■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.3■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.3■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NCAPD2Q15021 1401 aa21.29■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 YY1P25490 414 aa21.29■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.29■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.29■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 POLKQ9UBT6 870 aa21.28■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SPG7Q9UQ90 795 aa21.28■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.28■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LY75O60449 1722 aa21.27■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 POLD1P28340 1107 aa21.27■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.27■□□□□ 0.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CYP27B1O15528 508 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EYA1Q99502 592 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PANK3Q9H999 370 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KCNQ4P56696 695 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PALLDQ8WX93 1383 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PIGBQ92521 554 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PHKG2P15735 406 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MORC1Q86VD1 984 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ITGB4P16144 1822 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MSH5O43196 834 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SIK1P57059 783 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GPR162Q16538 588 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DCAF5Q96JK2 942 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C5P01031 1676 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SSFA2P28290 1259 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AK7Q96M32 723 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GRIN3BO60391 1043 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CHD4Q14839 1912 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ATG3Q9NT62 314 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ATP6V1AP38606 617 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KLHL34Q8N239 644 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C4BP0C0L5 1744 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KDRP35968 1356 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IL13P35225 146 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 252.9 ms