RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXA4-202ENST00000428284 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXA4-202ENST00000428284 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXA4-202ENST00000428284 RUNDC1Q96C34 613 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXA4-202ENST00000428284 DISP2A7MBM2 1401 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXA4-202ENST00000428284 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXA4-202ENST00000428284 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXA4-202ENST00000428284 BARGINQ6ZT62 677 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXA4-202ENST00000428284 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
HOXA4-202ENST00000428284 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC37A3O60309 1634 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 A0A0G2JS52 829 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 MYT1Q01538 1121 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 APAF1O14727 1248 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 SPG7Q9UQ90 795 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXA4-202ENST00000428284 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 TNS2Q63HR2 1409 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 DDB1Q16531 1140 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 EXOC5O00471 708 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 NEUROD2Q15784 382 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 NFE2L2Q16236 605 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
HOXA4-202ENST00000428284 RIPK4P57078 832 aa27.14■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.14■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 RGS12O14924 1447 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 MAP3K5Q99683 1374 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 CYP27B1O15528 508 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 PHKG2P15735 406 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 PDE3BQ13370 1112 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
HOXA4-202ENST00000428284 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 NGEFQ8N5V2 710 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 DCTN1Q14203 1278 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC27Q2M243 656 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 MCM10Q7L590 875 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 DCAF5Q96JK2 942 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 ITGB4P16144 1822 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.92
HOXA4-202ENST00000428284 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXA4-202ENST00000428284 WWC1Q8IX03 1113 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXA4-202ENST00000428284 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
HOXA4-202ENST00000428284 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
HOXA4-202ENST00000428284 IL17REQ8NFR9 667 aa27■■□□□ 1.91
HOXA4-202ENST00000428284 LGR6Q9HBX8 967 aa27■■□□□ 1.91
HOXA4-202ENST00000428284 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
HOXA4-202ENST00000428284 SBF2Q86WG5 1849 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXA4-202ENST00000428284 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXA4-202ENST00000428284 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXA4-202ENST00000428284 FAM182BQ5T319 152 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXA4-202ENST00000428284 TEFQ10587 303 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 MRC1P22897 1456 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF521Q96K83 1311 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 NHSQ6T4R5 1651 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 CABP4P57796 275 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 WDR63Q8IWG1 891 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 BCL9O00512 1426 aa26.91■■□□□ 1.9
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