RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399683.7

C20orf27-204, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

TSL 2

Gene C20orf27, Length 933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-204ENST00000399683 CCDC184Q52MB2 194 aa21.96■■□□□ 1.11
C20orf27-204ENST00000399683 EP400Q96L91 3159 aa21.96■■□□□ 1.11
C20orf27-204ENST00000399683 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 HMOX1P09601 288 aa21.94■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.94■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.94■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 FCHSD2O94868 740 aa21.93■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 MIER1Q8N108 512 aa21.93■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.93■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.92■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 A0A0G2JS52 829 aa21.92■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 MYT1Q01538 1121 aa21.92■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 DDB1Q16531 1140 aa21.92■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.91■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.91■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.91■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 ITGB4P16144 1822 aa21.9■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.89■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.89■■□□□ 1.1
C20orf27-204ENST00000399683 PRKAR2BP31323 418 aa21.89■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 NHSQ6T4R5 1651 aa21.88■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 EXOC5O00471 708 aa21.88■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.88■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 SPG7Q9UQ90 795 aa21.88■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.86■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 BCL9O00512 1426 aa21.86■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 PDE3BQ13370 1112 aa21.85■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.85■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.85■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
C20orf27-204ENST00000399683 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.82■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 NEFMP07197 916 aa21.82■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.82■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 CYP27B1O15528 508 aa21.81■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.81■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 BTAF1O14981 1849 aa21.8■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.8■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 RUNDC1Q96C34 613 aa21.8■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 MAP3K5Q99683 1374 aa21.79■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 PHKG2P15735 406 aa21.79■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 MRC1P22897 1456 aa21.78■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.78■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.77■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.77■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.77■■□□□ 1.08
C20orf27-204ENST00000399683 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.76■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 NFE2L2Q16236 605 aa21.75■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.75■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 PAPPAQ13219 1627 aa21.75■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 DCAF5Q96JK2 942 aa21.73■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.72■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 FAM182BQ5T319 152 aa21.72■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 ILDR2Q71H61 639 aa21.71■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 LY75O60449 1722 aa21.71■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.71■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.71■■□□□ 1.07
C20orf27-204ENST00000399683 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.7■■□□□ 1.06
C20orf27-204ENST00000399683 APAF1O14727 1248 aa21.68■■□□□ 1.06
C20orf27-204ENST00000399683 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.68■■□□□ 1.06
C20orf27-204ENST00000399683 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
C20orf27-204ENST00000399683 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.68■■□□□ 1.06
C20orf27-204ENST00000399683 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.67■■□□□ 1.06
C20orf27-204ENST00000399683 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
C20orf27-204ENST00000399683 RIPK4P57078 832 aa21.66■■□□□ 1.06
C20orf27-204ENST00000399683 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
C20orf27-204ENST00000399683 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.66■■□□□ 1.06
C20orf27-204ENST00000399683 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
C20orf27-204ENST00000399683 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
C20orf27-204ENST00000399683 RREB1Q92766 1687 aa21.64■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 NGEFQ8N5V2 710 aa21.64■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 IL17REQ8NFR9 667 aa21.64■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.63■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 LGR6Q9HBX8 967 aa21.63■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.62■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 CCDC27Q2M243 656 aa21.62■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.62■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.62■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.62■■□□□ 1.05
C20orf27-204ENST00000399683 KCNQ2O43526 872 aa21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms