RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371417.3

ARRDC1-AS1-201, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,409 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.03■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RUNDC1Q96C34 613 aa29.03■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RXRBP28702 533 aa29.02■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.01■■■□□ 2.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.99■■■□□ 2.23
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.99■■■□□ 2.23
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.99■■■□□ 2.23
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.96■■■□□ 2.23
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TNS2Q63HR2 1409 aa28.95■■■□□ 2.22
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.94■■■□□ 2.22
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.93■■■□□ 2.22
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 APAF1O14727 1248 aa28.92■■■□□ 2.22
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.91■■■□□ 2.22
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NFE2L2Q16236 605 aa28.91■■■□□ 2.22
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.87■■■□□ 2.21
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.86■■■□□ 2.21
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.86■■■□□ 2.21
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.84■■■□□ 2.21
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.81■■■□□ 2.2
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.77■■■□□ 2.2
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FAM182BQ5T319 152 aa28.77■■■□□ 2.2
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCDC27Q2M243 656 aa28.76■■■□□ 2.19
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ILDR2Q71H61 639 aa28.72■■■□□ 2.19
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.69■■■□□ 2.18
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZNF521Q96K83 1311 aa28.66■■■□□ 2.18
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TEFQ10587 303 aa28.64■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.64■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ITGB4P16144 1822 aa28.63■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SBF2Q86WG5 1849 aa28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KCNQ2O43526 872 aa28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WDR63Q8IWG1 891 aa28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
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