RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.54■■□□□ 1.36
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CCDC78-201ENST00000293889 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC78-201ENST00000293889 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC78-201ENST00000293889 APAF1O14727 1248 aa23.51■■□□□ 1.35
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CCDC78-201ENST00000293889 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC78-201ENST00000293889 DISP2A7MBM2 1401 aa23.46■■□□□ 1.35
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CCDC78-201ENST00000293889 A0A0G2JS52 829 aa23.44■■□□□ 1.34
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CCDC78-201ENST00000293889 MEGF6O75095 1541 aa23.43■■□□□ 1.34
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CCDC78-201ENST00000293889 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC78-201ENST00000293889 EP400Q96L91 3159 aa23.38■■□□□ 1.33
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CCDC78-201ENST00000293889 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.35■■□□□ 1.33
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CCDC78-201ENST00000293889 WWC1Q8IX03 1113 aa23.34■■□□□ 1.33
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CCDC78-201ENST00000293889 ZNF521Q96K83 1311 aa23.34■■□□□ 1.33
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CCDC78-201ENST00000293889 CYP27B1O15528 508 aa23.29■■□□□ 1.32
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CCDC78-201ENST00000293889 MCM10Q7L590 875 aa23.27■■□□□ 1.32
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CCDC78-201ENST00000293889 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.27■■□□□ 1.32
CCDC78-201ENST00000293889 SBF2Q86WG5 1849 aa23.27■■□□□ 1.32
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CCDC78-201ENST00000293889 WDR63Q8IWG1 891 aa23.26■■□□□ 1.31
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CCDC78-201ENST00000293889 GOLGA2Q08379 1002 aa23.25■■□□□ 1.31
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CCDC78-201ENST00000293889 IL16Q14005 1332 aa23.2■■□□□ 1.3
CCDC78-201ENST00000293889 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
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CCDC78-201ENST00000293889 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
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CCDC78-201ENST00000293889 SLFN5Q08AF3 891 aa23.19■■□□□ 1.3
CCDC78-201ENST00000293889 DCAF5Q96JK2 942 aa23.19■■□□□ 1.3
CCDC78-201ENST00000293889 BCL9O00512 1426 aa23.19■■□□□ 1.3
CCDC78-201ENST00000293889 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.19■■□□□ 1.3
CCDC78-201ENST00000293889 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
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CCDC78-201ENST00000293889 E9PSI1 815 aa23.18■■□□□ 1.3
CCDC78-201ENST00000293889 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
CCDC78-201ENST00000293889 SOCS7O14512 581 aa23.17■■□□□ 1.3
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