RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216268.5

ZBED4-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED4, Length 6,893 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4-201ENST00000216268 DACH1Q9UI36 760 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 SMTNL1A8MU46 457 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 SPATA24Q86W54 205 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 LRSAM1Q6UWE0 723 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 TAX1BP1Q86VP1 789 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 GSDMDP57764 484 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 NAA25Q14CX7 972 aa13.34□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 NUP133Q8WUM0 1156 aa13.33□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 CEP57Q86XR8 500 aa13.33□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 KIF5CO60282 957 aa13.33□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 ARFGAP3Q9NP61 516 aa13.33□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.33□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 MYRIPQ8NFW9 859 aa13.32□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 ATP6V1AP38606 617 aa13.32□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 GCC1Q96CN9 775 aa13.32□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa13.32□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 RPAINQ86UA6 219 aa13.32□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa13.32□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 SSFA2P28290 1259 aa13.32□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 AP1ARQ63HQ0 302 aa13.32□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 NBPF11Q86T75 865 aa13.32□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 EBAG9O00559 213 aa13.31□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.31□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 DAPK1P53355 1430 aa13.31□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 FOSBP53539 338 aa13.31□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa13.31□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 NEBLO76041 1014 aa13.31□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 MSL1Q68DK7 614 aa13.31□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 TMX1Q9H3N1 280 aa13.31□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 SLU7O95391 586 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 ERC1Q8IUD2 1116 aa13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 PRM3Q9NNZ6 103 aa13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 ADAMTS12P58397 1594 aa13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC175P0C221 793 aa13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 TUBB4AP04350 444 aa13.3□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 SPATA32Q96LK8 384 aa13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 NAIPQ13075 1403 aa13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 OTUD6BQ8N6M0 293 aa13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 EFCC1Q9HA90 598 aa13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 ERC2O15083 957 aa13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 SEPT6Q14141 434 aa13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 PBRM1Q86U86 1689 aa13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 PTPRKQ15262 1439 aa13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 A0A0G2JS52 829 aa13.28□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP13.28□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.28□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 CERS3Q8IU89 383 aa13.28□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 MARCH6O60337 910 aa13.28□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 WDR62O43379 1518 aa13.28□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 BAG4O95429 457 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 KIF5BP33176 963 aa13.28□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 POTEDQ86YR6 584 aa13.28□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.28□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 WDR63Q8IWG1 891 aa13.27□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.27□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
ZBED4-201ENST00000216268 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 CEP112Q8N8E3 955 aa13.27□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 STK38Q15208 465 aa13.27□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 SCLT1Q96NL6 688 aa13.27□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 VPS18Q9P253 973 aa13.27□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 RUNDC1Q96C34 613 aa13.26□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC83Q8IWF9 413 aa13.26□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 MIPOL1Q8TD10 442 aa13.26□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC121Q6ZUS5 278 aa13.26□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC50Q8IVM0 306 aa13.26□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 ABCC5O15440 1437 aa13.26□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 ATP10BO94823 1461 aa13.26□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC150Q8NCX0 1101 aa13.26□□□□□ -0.29
ZBED4-201ENST00000216268 ANO10Q9NW15 660 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms