RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000211953.1

Lncbate1-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lncbate1, Length 812 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 TnrQ8BYI9 1358 aa9.17□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Csrnp3P59055 597 aa9.17□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Eya1P97767 591 aa9.17□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa9.17□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Neurod2Q62414 383 aa9.17□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dixdc1Q80Y83 711 aa9.17□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cadps2Q8BYR5 1297 aa9.17□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Eno4Q8C042 619 aa9.17□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CastP51125 788 aa9.16□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 TatQ8QZR1 454 aa9.16□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Arfgef2A2A5R2 1792 aa9.16□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa9.15□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Card10P58660 1021 aa9.15□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 ZgpatQ8VDM1 511 aa9.15□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 HypkQ9CR41 129 aa9.15□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atxn3Q9CVD2 355 aa9.15□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Txnrd1Q9JMH6 613 aa9.15□□□□□ -0.94
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Znf521Q6KAS7 1311 aa9.14□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ksr2Q3UVC0 959 aa9.14□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Trim58Q5NCC9 485 aa9.14□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rgs17Q9QZB0 210 aa9.14□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Simc1E9Q6E9 1354 aa9.13□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa9.13□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pde4dQ01063 747 aa9.13□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccne1Q61457 408 aa9.13□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dzip1Q8BMD2 852 aa9.13□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Emilin2Q8K482 1074 aa9.13□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ferd3lQ923Z4 168 aa9.13□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Amotl1Q9D4H4 968 aa9.13□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 FocadA2AKG8 1798 aa9.13□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Abcc12Q80WJ6 1366 aa9.12□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa9.12□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Igsf1Q7TQA1 1317 aa9.12□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 NeflP08551 543 aa9.12□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 MpripP97434 1024 aa9.12□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Slx1bQ8BX32 270 aa9.12□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 TkfcQ8VC30 578 aa9.12□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Psrc1Q9D0P7 329 aa9.12□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dnajc10Q9DC23 793 aa9.12□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cabp2Q9JLK4 216 aa9.12□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Shank2Q80Z38 1476 aa9.12□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Slit1Q80TR4 1531 aa9.11□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 HdgfP51859 237 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gas2l2Q5SSG4 860 aa9.11□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa9.11□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ltbp1Q8CG19 1712 aa9.11□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Vamp4O70480 141 aa9.1□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mcm10Q0VBD2 885 aa9.1□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fam117bQ3U3E2 584 aa9.1□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa9.1□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Amotl2Q8K371 772 aa9.1□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 InhbeO08717 350 aa9.09□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem132eQ6IEE6 982 aa9.09□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Col15a1O35206 1367 aa9.09□□□□□ -0.95
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tnks1bp1P58871 1720 aa9.08□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pard3Q99NH2 1333 aa9.07□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fer1l6E0CZ42 1862 aa9.07□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Plekhd1B2RPU2 505 aa9.07□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa9.06□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Col22a1E9Q7P1 1613 aa9.06□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mast2Q60592 1734 aa9.06□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm21698A0A087WQP8 267 aa9.06□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm21671G3UY31 267 aa9.06□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CrklP47941 303 aa9.06□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc129Q14B48 1034 aa9.06□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa9.06□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc60Q8C4J0 545 aa9.06□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 OptnQ8K3K8 584 aa9.06□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Usp16Q99LG0 825 aa9.06□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cacna1sQ02789 1880 aa9.06□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Aox2Q5SGK3 1345 aa9.05□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tns2Q8CGB6 1400 aa9.05□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ildr2B5TVM2 661 aa9.05□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Chl1P70232 1209 aa9.05□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hs1bp3Q3TC93 395 aa9.05□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rtl5Q5DTT4 599 aa9.05□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa9.05□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Anp32aO35381 247 aa9.04□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Repin1Q5U4E2 545 aa9.04□□□□□ -0.96
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 ThemisQ8BGW0 636 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 75.6 ms