RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000113312.8

Shq1-202, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 6,816 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-202ENSMUST00000113312 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
Shq1-202ENSMUST00000113312 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
Shq1-202ENSMUST00000113312 Olr1Q9EQ09 363 aa19.4■□□□□ 0.7
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ttll12Q3UDE2 639 aa19.39■□□□□ 0.7
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ctnna2Q61301 953 aa19.39■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 NsmfQ99NF2 532 aa19.39■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cpa2Q504N0 417 aa19.39■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rufy2Q8R4C2 606 aa19.38■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 AdnpQ9Z103 1108 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Zbtb21E9Q444 1094 aa19.38■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa19.38■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krt85Q9Z2T6 507 aa19.38■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Nap1l5Q9JJF0 156 aa19.37■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa19.37■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lmbr1Q9JIT0 490 aa19.37■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Map3k5O35099 1380 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tspyl3Q3UYP3 334 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Atl3Q91YH5 541 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc112A0AUP1 442 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 GnpatP98192 678 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 AidaQ8C4Q6 305 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Zeb2Q9R0G7 1215 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Epb41l3Q9WV92 929 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Stxbp4Q9WV89 557 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Map9Q3TRR0 646 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Q4VA45 678 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Jph4Q80WT0 628 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cetn2Q9R1K9 172 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Irgm2A0A140LIF8 407 aa19.36■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc155Q80VJ8 648 aa19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Arhgap5P97393 1501 aa19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Zfp42P22227 288 aa19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Neurog2P70447 263 aa19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Phldb2Q8K1N2 1249 aa19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gps2Q921N8 327 aa19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cetn1P41209 172 aa19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gas2l3Q3UWW6 683 aa19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Jade2Q6ZQF7 829 aa19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Q7TT23 1179 aa19.35■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sept7O55131 436 aa19.34■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 CastP51125 788 aa19.34■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tsg101Q61187 391 aa19.34■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Pde4cQ3UEI1 686 aa19.34■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Chmp6P0C0A3 200 aa19.34■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Nf2P46662 596 aa19.34■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 CenpqQ9CPQ5 267 aa19.34■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Brf1Q8CFK2 676 aa19.33■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa19.33■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ncoa2Q61026 1462 aa19.33■□□□□ 0.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cog6Q8R3I3 657 aa19.33■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cfap45Q9D9U9 551 aa19.33■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Snx25Q3ZT31 840 aa19.33■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cavin4A2AMM0 362 aa19.32■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Usp5P56399 858 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 PalmQ9Z0P4 383 aa19.32■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa19.32■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ctage5Q8R311 779 aa19.32■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Zmynd15Q8C0R7 736 aa19.32■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Znf394Q9Z1D9 521 aa19.31■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ift57Q8BXG3 429 aa19.31■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 StambpQ9CQ26 424 aa19.31■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rab3il1Q8VDV3 383 aa19.31■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 GpkowQ56A08 488 aa19.31■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mcm2P97310 904 aa19.31■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tmem87aQ8BXN9 555 aa19.31■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Armc3A2AU72 881 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Arl1P61211 181 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Carmil1Q6EDY6 1374 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Txndc16Q7TN22 820 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Slu7Q8BHJ9 585 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Riok1Q922Q2 567 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 NapbP28663 298 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tmod2Q9JKK7 351 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fam170aQ66LM6 333 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Nop53Q8BK35 484 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Pet2A2AHY8 747 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Trim55G3X8Y1 545 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Zbtb3Q91X45 518 aa19.3■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Wasf1Q8R5H6 559 aa19.29■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sept6Q9R1T4 434 aa19.29■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Kdm5dQ62240 1548 aa19.29■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ppfia3P60469 1194 aa19.29■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Slc26a8Q8R0C3 999 aa19.29■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rhot2Q8JZN7 620 aa19.28■□□□□ 0.68
Shq1-202ENSMUST00000113312 ZgpatQ8VDM1 511 aa19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.2 ms