RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107818.8

Ankrd40-203, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene Ankrd40, Length 3,487 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa22.85■■□□□ 1.25
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Pdcl2Q78Y63 240 aa22.85■■□□□ 1.25
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa22.85■■□□□ 1.25
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Cep170Q6A065 1588 aa22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Zkscan2G3X952 960 aa22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Mcm2P97310 904 aa22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Zdhhc9P59268 364 aa22.83■■□□□ 1.25
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 KinQ8K339 391 aa22.83■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Nphp1Q9QY53 687 aa22.83■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 NhsB1AV60 1647 aa22.82■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Gm973E9Q295 1059 aa22.82■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Myo3aQ8K3H5 1613 aa22.81■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 EngaseQ8BX80 734 aa22.81■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Zpr1Q62384 459 aa22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Nphp4P59240 1425 aa22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Ccdc173A0JLY1 547 aa22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Wdr78E9PYY5 807 aa22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Kif3aP28741 701 aa22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Atg4aQ8C9S8 396 aa22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Mmel1Q9JLI3 765 aa22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 RdxP26043 583 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Psme1P97371 249 aa22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Cnnm3Q32NY4 713 aa22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Fchsd2Q3USJ8 740 aa22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Snap23O09044 210 aa22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Prim1P20664 417 aa22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 MpndQ3TV65 487 aa22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Hvcn1Q3U2S8 269 aa22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Kdm4aQ8BW72 1064 aa22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Tceanc2Q8R2M0 207 aa22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Gm45015A0A140LII9 184 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Gm18336A0A140LIU8 765 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Ppfia3P60469 1194 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Snx13Q6PHS6 957 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 MecomP14404 1042 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Aldh8a1Q8BH00 487 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Iffo2Q8R2V2 512 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Map3k13Q1HKZ5 959 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Fam83gQ5SWY7 812 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Pnma3Q8JZW8 466 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Bcl2l13P59017 434 aa22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Fam43aQ8BUP8 424 aa22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Adgrl3Q80TS3 1537 aa22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Ptgs1P22437 602 aa22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Depdc5P61460 1591 aa22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 RestQ8VIG1 1082 aa22.74■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Rnf17Q99MV7 1640 aa22.74■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 U2af2P26369 475 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa22.74■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 InsrP15208 1372 aa22.73■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Bach2P97303 839 aa22.73■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Cabp4Q8VHC5 271 aa22.73■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Lekr1B2RVN1 116 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Gjb2Q00977 226 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Nap1l3Q794H2 544 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Rassf8Q8CJ96 419 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Abca8bQ8K440 1620 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Sass6Q80UK7 654 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Adam1bQ8R534 806 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Tceal9Q9DD24 104 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Zbtb45Q52KG4 520 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Bicd2Q921C5 820 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Anp32cQ64G17 123 aa22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Ccdc94Q9D6J3 314 aa22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Zfyve16Q80U44 1528 aa22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Grpel1Q99LP6 217 aa22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Cfap73J3QPZ5 306 aa22.7■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Abcc3B2RX12 1523 aa22.69■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 EzrP26040 586 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Ccdc66Q6NS45 935 aa22.69■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Sh3bp5Q9Z131 463 aa22.69■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Yeats2Q3TUF7 1407 aa22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 PaskQ8CEE6 1383 aa22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Slc52a2Q9D8F3 450 aa22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Cspp1B2RX88 1205 aa22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Ccdc178Q8CDV0 866 aa22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40-203ENSMUST00000107818 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.3 ms