RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028377.13

Scn2a-201, Transcript of Sodium channel protein, mousemouse

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene Scn2a, Length 8,935 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Kdm5cP41230 1554 aa6.69□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Hvcn1Q3U2S8 269 aa6.69□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Cep131Q62036 1060 aa6.69□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Pank1Q8K4K6 548 aa6.69□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Cabp4Q8VHC5 271 aa6.69□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Znf330Q922H9 316 aa6.69□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Arhgef11Q68FM7 1552 aa6.69□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ppp1r15aP17564 657 aa6.69□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Fam107bQ3TGF2 131 aa6.69□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ctage5Q8R311 779 aa6.69□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Mug2P28666 1451 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Pnmal2G3X9N3 661 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Arid3aQ62431 601 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Hook3Q8BUK6 718 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 TnmdQ9EP64 317 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Igbp1bQ9QZ29 343 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Trim55G3X8Y1 545 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Cfap157Q0VFX2 523 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Kdm5bQ80Y84 1544 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Smtnl1Q99LM3 459 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Prr29B1ARI9 187 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Triml2E9PW10 424 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 ZgpatQ8VDM1 511 aa6.68□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Cyp26c1B2RXA7 518 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Myo1bP46735 1107 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Rassf4Q8CB96 322 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Krt84Q99M73 603 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Cdc45Q9Z1X9 566 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ccdc121E9Q6D3 323 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Brms1Q99N20 246 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Phactr2B1AVP0 632 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Uggt1Q6P5E4 1551 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Shq1Q7TMX5 569 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Erlin1Q91X78 346 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Pla2r1Q62028 1487 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ube2hP62257 183 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ccdc191J3QQ27 883 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Aldh1l2Q8K009 923 aa6.67□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ssh1Q76I79 1042 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Gm10093D3YYI8 482 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Dusp27Q148W8 1138 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Stard3nlQ9DCI3 235 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Tmx4Q8C0L0 335 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Krt82Q99M74 516 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Abcc6Q9R1S7 1498 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ehbp1Q69ZW3 1231 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 TkfcQ8VC30 578 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Sycp1Q62209 993 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Cfap53Q9D439 514 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ssh2Q5SW75 1423 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Plekhd1B2RPU2 505 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 CrcpO35427 148 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ppp4r3bQ922R5 820 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 PalldQ9ET54 1408 aa6.66□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Trim11Q99PQ2 467 aa6.65□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Nphp3Q7TNH6 1325 aa6.65□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa6.65□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Q8C5K5 320 aa6.65□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Paxbp1P58501 919 aa6.65□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Tubb2aQ7TMM9 445 aa6.65□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Tubb2bQ9CWF2 445 aa6.65□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Nap1l5Q9JJF0 156 aa6.65□□□□□ -1.34
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Morc2aQ69ZX6 1030 aa6.65□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Aldh8a1Q8BH00 487 aa6.65□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Lrrc45Q8CIM1 670 aa6.65□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Mical3Q8CJ19 1993 aa6.65□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Fmnl2A2APV2 1086 aa6.65□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 LifrP42703 1092 aa6.65□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Stk38Q91VJ4 465 aa6.65□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Rufy2Q8R4C2 606 aa6.65□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Jakmip3Q5DTN8 844 aa6.64□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa6.64□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 TefQ9JLC6 301 aa6.64□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Abca16E9PWJ7 1678 aa6.64□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Neo1P97798 1493 aa6.64□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Me1P06801 572 aa6.64□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Ccdc96Q9CR92 584 aa6.64□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Znf287Q9EQB9 759 aa6.64□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Astn2Q80Z10 1352 aa6.64□□□□□ -1.35
Scn2a-201ENSMUST00000028377 Stx1aO35526 288 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.5 ms