RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641480.1

CASC19-232, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

BASIC

Gene CASC19, Length 1,244 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-232ENST00000641480 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ATRXP46100 2492 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 A0A0D9SEW6 157 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ANHXE9PGG2 379 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 H0Y626 953 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 GOLGA8TH3BQL2 631 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 MUSKO15146 869 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 FZD6O60353 706 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 LRP3O75074 770 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PSMG1O95456 288 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 MLYCDO95822 493 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 IGSF6O95976 241 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 LRG1P02750 347 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 KLKB1P03952 638 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CYBBP04839 570 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 FGF4P08620 206 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CCDC166P0CW27 439 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 COX4I1P13073 169 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 TCF3P15923 654 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ACADSP16219 412 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 GNAZP19086 355 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 SAT1P21673 171 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 MPSTP25325 297 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 HOXA9P31269 272 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CPOXP36551 454 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 VHLP40337 213 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PTGER3P43115 390 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ACADVLP49748 655 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 SCNN1BP51168 640 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ARSDP51689 593 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 RHOAP61586 193 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 RPS24P62847 133 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 AP2B1P63010 937 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ARF5P84085 180 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 XIAPP98170 497 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 KDSRQ06136 332 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CACNG1Q06432 222 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 SULT2A1Q06520 285 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 KLF10Q13118 480 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 DMC1Q14565 340 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CYTH1Q15438 398 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CCDC6Q16204 474 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 RFWD3Q6PCD5 774 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 RINLQ6ZS11 566 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CHSY3Q70JA7 882 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 TMEM126BQ8IUX1 230 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 MFSD6LQ8IWD5 586 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 KDM1BQ8NB78 822 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 RIN3Q8TB24 985 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 TSPEARQ8WU66 669 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 LPGAT1Q92604 370 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 DLG3Q92796 817 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 MYO19Q96H55 970 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 TBATAQ96M53 351 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 LYSMD1Q96S90 227 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 OLFM1Q99784 485 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 IER2Q9BTL4 223 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CEP44Q9C0F1 390 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 IL21Q9HBE4 155 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ZBTB26Q9HCK0 441 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CD248Q9HCU0 757 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 LHX3Q9UBR4 397 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 APPL1Q9UKG1 709 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PKP3Q9Y446 797 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 E2F8A0AVK6 867 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CCDC78A2IDD5 438 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CBX4O00257 560 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 GRID2O43424 1007 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 KLK8O60259 260 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms