RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 PSTPIP1O43586 416 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 NUAK1O60285 661 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 GPR89BP0CG08 455 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 CDKN2BP42772 138 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 NR2C2P49116 596 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 CLCNKAP51800 687 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 RAB15P59190 212 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 CDK18Q07002 472 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 TEX44Q53QW1 395 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.78■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 TMC3Q7Z5M5 1100 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 GPR26Q8NDV2 337 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 ART4Q93070 314 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 RAD18Q9NS91 495 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 TBC1D29Q9UFV1 150 aa21.78■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 ZNF711Q9Y462 761 aa21.78■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa21.78■■□□□ 1.08
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SRRT-218ENST00000620394 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 RAD1O60671 282 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 ACP5P13686 325 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 F3P13726 295 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 COMTP21964 271 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 PTPN3P26045 913 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 HHEXQ03014 270 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 FAM182AQ5T1J6 154 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 TMEM71Q6P5X7 295 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 IYDQ6PHW0 289 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 FAM26EQ8N5C1 309 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 TRAM1L1Q8N609 369 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 RNF214Q8ND24 703 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 SLC45A3Q96JT2 553 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 TEKT5Q96M29 485 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 GLOD4Q9HC38 313 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 TMEM9Q9P0T7 183 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 ATXN10Q9UBB4 475 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 KCNK6Q9Y257 313 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 HYOU1Q9Y4L1 999 aa21.77■■□□□ 1.08
SRRT-218ENST00000620394 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 SPOPO43791 374 aa21.76■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 DUX1O43812 170 aa21.76■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 NDST3O95803 873 aa21.76■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 SLC2A4P14672 509 aa21.76■■□□□ 1.07
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SRRT-218ENST00000620394 DYNLT1P63172 113 aa21.76■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 TFDP2Q14188 446 aa21.76■■□□□ 1.07
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SRRT-218ENST00000620394 SARM1Q6SZW1 724 aa21.76■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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SRRT-218ENST00000620394 SPATA16Q9BXB7 569 aa21.76■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.76■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa21.76■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 A0A0G2JNG1 304 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 B4E171 279 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 KIR2DS3K7RE56 304 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 CHUKO15111 745 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 GRID2O43424 1007 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 LCA5LO95447 670 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 PIRTP0C851 137 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 TSPAN7P41732 249 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 KIR2DS5Q14953 304 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 PCSK7Q16549 785 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 ODF2Q5BJF6 829 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 DCAF12Q5T6F0 453 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 AVL9Q8NBF6 648 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 EFHD1Q9BUP0 239 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 ZMYND15Q9H091 742 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 TRIM39Q9HCM9 518 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 SLC39A1Q9NY26 324 aa21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 NBASA2RRP1 2371 aa21.74■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 PRR19A6NJB7 356 aa21.74■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 OR5K4A6NMS3 321 aa21.74■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 CD68P34810 354 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 WASHC5Q12768 1159 aa21.74■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 CDC20Q12834 499 aa21.74■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 ALS2CLQ60I27 953 aa21.74■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa21.74■■□□□ 1.07
SRRT-218ENST00000620394 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa21.74■■□□□ 1.07
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