RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MTSS1	O43312	755 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PIRT	P0C851	137 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	GP1BB	P13224	206 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC2A4	P14672	509 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CA4	P22748	312 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNC	P24863	283 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	DLST	P36957	453 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC19A1	P41440	591 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPHS1	P49903	392 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TAS2R40	P59535	323 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MC1R	Q01726	317 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR26	Q8NDV2	337 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	FAF2	Q96CS3	445 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TGM7	Q96PF1	710 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIB3	Q96RU7	358 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF670	Q9BS34	389 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NOTCH2	Q04721	2471 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087X0T9	212 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5K4	A6NMS3	321 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNK1	O00180	336 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CHUK	O15111	745 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MTX2	O75431	263 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA0754	O94854	1291 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	UBXN7	O94888	489 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC4A1	P02730	911 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PDGFA	P04085	211 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM228B	P0C875	321 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	BRAF	P15056	766 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CES1	P23141	567 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPZB	P47756	277 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CD97	P48960	835 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CLCNKA	P51800	687 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MLLT10	P55197	1068 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1CA	P62136	330 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KLRB1	Q12918	225 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	HDAC11	Q96DB2	347 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	OR6C1	Q96RD1	312 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	UCK1	Q9HA47	277 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJB5	O75953	348 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MTA2	O94776	668 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFA10	O95299	355 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TIAF1	O95411	115 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	JCHAIN	P01591	159 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	UQCRFS1	P47985	274 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	DCDC1	P59894	354 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPT6	Q14141	434 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR18	Q14330	331 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	INSC	Q1MX18	579 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	GLYATL1	Q969I3	302 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.75	□□□□□ -0.53

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