RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 BBS5Q8N3I7 341 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 CT55Q8WUE5 264 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 NSMCE1Q8WV22 266 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 LYSMD1Q96S90 227 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 HERPUD2Q9BSE4 406 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 TWSG1Q9GZX9 223 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 BRD8Q9H0E9 1235 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 PCDH9Q9HC56 1237 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 LMBRD1Q9NUN5 540 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 POLHQ9Y253 713 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 MATN3O15232 486 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 CREG1O75629 220 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 UBXN7O94888 489 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 HLA-DQB2P05538 268 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 FGF5P12034 268 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 GZMAP12544 262 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 COL8A1P27658 744 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 GARSP41250 739 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 PMS2P54278 862 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 GALNT2Q10471 571 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 DNASE1L3Q13609 305 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 CPZQ66K79 652 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 CRTC3Q6UUV7 619 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 FAM92BQ6ZTR7 304 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 RASGRP3Q8IV61 690 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF547Q8IVP9 402 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 NDUFAF2Q8N183 169 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 GPR26Q8NDV2 337 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 KLHL6Q8WZ60 621 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 CARD9Q9H257 536 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 TRIM10Q9UDY6 481 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 OR5K4A6NMS3 321 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 OR52A4PA6NMU1 304 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 TTLL8A6PVC2 850 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 MTX2O75431 263 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 RFPL1O75677 317 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 PYGLP06737 847 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 PIRTP0C851 137 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 FOLR1P15328 257 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 AMD1P17707 334 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 RPL10P27635 214 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 CLCNKAP51800 687 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 SEMA5AQ13591 1074 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 LAMB3Q13751 1172 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 KCNAB1Q14722 419 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 ASIC2Q16515 512 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 ALS2CLQ60I27 953 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 AOPEPQ8N6M6 819 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 FAM71BQ8TC56 605 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 CPT1CQ8TCG5 803 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 ISCUQ9H1K1 167 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 RMI1Q9H9A7 625 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 UCK1Q9HA47 277 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 LHX9Q9NQ69 397 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 AIPL1Q9NZN9 384 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 PADI1Q9ULC6 663 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 WDR37Q9Y2I8 494 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 TTLL3Q9Y4R7 772 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-228ENST00000599236 POLQO75417 2590 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 AKAP9Q99996 3911 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 A1L4Q6 167 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 ANKRD66B4E2M5 251 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 CHUKO15111 745 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 RASSF9O75901 435 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 AGFG2O95081 481 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 VIPP01282 170 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC172P0C7W6 258 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 MYL5Q02045 173 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 GPR18Q14330 331 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 IL11RAQ14626 422 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 FHL5Q5TD97 284 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 CACHD1Q5VU97 1274 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 FAM69BQ5VUD6 431 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-228ENST00000599236 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms