RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583340.1

SUPT6H-208, Transcript of SPT6 homolog, histone chaperone, humanhuman

TSL 3

Gene SUPT6H, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT6H-208ENST00000583340 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 LINC00523Q86TU6 105 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 CCDC25Q86WR0 208 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 RELL1Q8IUW5 271 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 RBFAQ8N0V3 343 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 AVL9Q8NBF6 648 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 PDXPQ96GD0 296 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 OR2M4Q96R27 311 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 CCDC77Q9BR77 488 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 BOCQ9BWV1 1114 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 LRRC40Q9H9A6 602 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 PPCSQ9HAB8 311 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 CD84Q9UIB8 345 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa8.5□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 TMEM202A6NGA9 273 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 E7EVH7 732 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 YY2O15391 372 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 RIPK2O43353 540 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 GCATO75600 419 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 IFNB1P01574 187 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 ABHD2P08910 425 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 VCLP18206 1134 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 NR1D1P20393 614 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 IVDP26440 423 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 PSMB4P28070 264 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 FDFT1P37268 417 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 SPAM1P38567 509 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 GNPDA1P46926 289 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 LMAN1P49257 510 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 VPS41P49754 854 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 GPS1Q13098 491 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 C1orf61Q13536 156 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 ITGA9Q13797 1035 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 TTMPQ5BVD1 217 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 SIRPB2Q5JXA9 342 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 DOK6Q6PKX4 331 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 DHRS13Q6UX07 377 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 CENPUQ71F23 418 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 IFI44Q8TCB0 444 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 MAPK15Q8TD08 544 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 DTX3LQ8TDB6 740 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 OR1E3Q8WZA6 343 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 SCAMP4Q969E2 229 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 FICDQ9BVA6 458 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 FGF22Q9HCT0 170 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 PAK5Q9P286 719 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 GULP1Q9UBP9 304 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 KLF15Q9UIH9 416 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 PADI4Q9UM07 663 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 SUFUQ9UMX1 484 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 NFS1Q9Y697 457 aa8.49□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 CPED1A4D0V7 1026 aa8.48□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 F5H423 210 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.48□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 AP3B1O00203 1094 aa8.48□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 INPP4BO15327 924 aa8.48□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 VEGFDO43915 354 aa8.48□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 TCEA3O75764 348 aa8.48□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 AGTP01019 485 aa8.48□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 CEACAM5P06731 702 aa8.48□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 PIRTP0C851 137 aa8.48□□□□□ -1.05
SUPT6H-208ENST00000583340 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms