RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
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PTPRM-211ENST00000580170 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRM-211ENST00000580170 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
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PTPRM-211ENST00000580170 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
PTPRM-211ENST00000580170 TCEAL5Q5H9L2 206 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRM-211ENST00000580170 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRM-211ENST00000580170 C17orf64Q86WR6 236 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRM-211ENST00000580170 PYROXD2Q8N2H3 581 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRM-211ENST00000580170 MFSD3Q96ES6 412 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRM-211ENST00000580170 ALG2Q9H553 416 aa21.19■□□□□ 0.98
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