RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-208	ENST00000556007	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	TSPY1	Q01534	308 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	GAGE5	Q13069	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	GAGE6	Q13070	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	LCTL	Q6UWM7	567 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	RRM2B	Q7LG56	351 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	RADIL	Q96JH8	1075 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	PIP5K1A	Q99755	562 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	SYNC	Q9H7C4	482 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	KCND2	Q9NZV8	630 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007		A0A1W2PQM1	296 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	CTAGE9	A4FU28	777 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	UTY	O14607	1347 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	3.57	□□□□□ -1.84	4e-8	■□□□□ 8.6
TIMM9-208	ENST00000556007	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	LDLR	P01130	860 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	SPARC	P09486	303 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	CLTB	P09497	229 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	CTAGE8	P0CG41	777 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	MYOD1	P15172	320 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	IL11	P20809	199 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	BDKRB2	P30411	391 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	ABCD1	P33897	745 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	PBX3	P40426	434 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	ATP12A	P54707	1039 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	SNX16	P57768	344 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	UFM1	P61960	85 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	PSMC6	P62333	389 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	PDE1B	Q01064	536 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	CHAF1B	Q13112	559 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	PPP2R5B	Q15173	497 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	MED22	Q15528	200 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	FRG2	Q64ET8	278 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	C17orf77	Q96MU5	243 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	SYT17	Q9BSW7	474 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	GPR108	Q9NPR9	543 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	MPP6	Q9NZW5	540 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	WDR1	O75083	606 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	BEST1	O76090	585 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	RNF224	P0DH78	156 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	NFKBIA	P25963	317 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	BSG	P35613	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	ROR1	Q01973	937 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF234	Q14588	700 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	TDRP	Q86YL5	185 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	FRMD1	Q8N878	549 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	ALG14	Q96F25	216 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	CALML4	Q96GE6	196 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	KLHL15	Q96M94	604 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	F2RL3	Q96RI0	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	NDST4	Q9H3R1	872 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TIMM9-208	ENST00000556007	MRGBP	Q9NV56	204 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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