RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 ZNF358Q9NW07 568 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 MPP6Q9NZW5 540 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 PDP2Q9P2J9 529 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 VPS51Q9UID3 782 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 PADI1Q9ULC6 663 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 NEU3Q9UQ49 428 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 ILVBLA1L0T0 632 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 WASH4PA8MWX3 477 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 PCDH17O14917 1159 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 MTA2O94776 668 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 PROSCO94903 275 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 ZWINTO95229 277 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 PRNPP04156 253 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 CTSLP07711 333 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 SRCP12931 536 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 ZNF28P17035 718 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 RHOQP17081 205 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 OR1E1P30953 314 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 CHRNA3P32297 505 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 CLCN6P51797 869 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 YPEL5P62699 121 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 RPS21P63220 83 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 TCEAL1Q15170 157 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 DPYSL2Q16555 572 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 CA9Q16790 459 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 BOLA3Q53S33 107 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 FAAH2Q6GMR7 532 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 MACC1Q6ZN28 852 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 SYVN1Q86TM6 617 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 DCAF4L2Q8NA75 395 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 ATP11CQ8NB49 1132 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 TEKT4Q8WW24 435 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 TM9SF4Q92544 642 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 PSMB7Q99436 277 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 GPR87Q9BY21 358 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 HDAC8Q9BY41 377 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 MUC3BQ9H195 1237 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 DYRK4Q9NR20 520 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 A0A0D9SEW6 157 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 CREB3O43889 395 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 BNIP3LO60238 219 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 SNAP91O60641 907 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 TMEM63AO94886 807 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 NDUFA10O95299 355 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 MT-CO1P00395 513 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 ALPPP05187 535 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 RARAP10276 462 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 TCF4P15884 667 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 IL1R2P27930 398 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 EPHB2P29323 1055 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 ETFBP38117 255 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 ARHGAP25P42331 645 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 MAGEA1P43355 309 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 GPR3P46089 330 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 HCAR3P49019 387 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 NDST2P52849 883 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 GSDMDP57764 484 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 TPI1P60174 286 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 GNA12Q03113 381 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 SPA17Q15506 151 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 TCEA2Q15560 299 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 SHEQ5VZ18 495 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-225ENST00000551253 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa7.03□□□□□ -1.28
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