RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545279.5

SMAD5-211, Transcript of SMAD family member 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5, Length 7,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-211ENST00000545279 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 TCEA3O75764 348 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 MATN4O95460 622 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 RETP07949 1114 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 POLD2P49005 469 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 CTBP2P56545 445 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 MAXP61244 160 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 HTR3DQ70Z44 454 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 SMOQ99835 787 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 NGBQ9NPG2 151 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 NCANO14594 1321 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 A0A087X0T9 212 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 WDR91A4D1P6 747 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 LDB2O43679 373 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 ABCB7O75027 752 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 FAM228BP0C875 321 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 TCF3P15923 654 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 HOXD12P35452 270 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 AP1S2P56377 157 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 ACTR3P61158 418 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 SLC13A2Q13183 592 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 CCDC153Q494R4 210 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 Q7L0L9 218 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 ZNF563Q8TA94 476 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 CYP17A1P05093 508 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 ICAM2P13598 275 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 SEPHS1P49903 392 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 PMF1Q6P1K2 205 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 OSTM1Q86WC4 334 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 ESX1Q8N693 406 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 SLC5A8Q8N695 610 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 EID2Q8N6I1 236 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 LPAR4Q99677 370 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 A8MU76 341 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 MCIDASD6RGH6 385 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 SOX30O94993 753 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 MAP3K6O95382 1288 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 PROS1P07225 676 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 POU2F2P09086 479 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 MMP8P22894 467 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 SESN3P58005 492 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 SEMG2Q02383 582 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 RASA2Q15283 850 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 PKDCCQ504Y2 493 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 TMEM110Q86TL2 294 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 C9orf72Q96LT7 481 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 ERP44Q9BS26 406 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 MIOSQ9NXC5 875 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 FZD4Q9ULV1 537 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 IFT172Q9UG01 1749 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 A0A0G2JND7 137 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 MGAT1P26572 445 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 HNF4AP41235 474 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 CLCNKAP51800 687 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 SP140Q13342 867 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 SCML4Q8N228 414 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 GDF15Q99988 308 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 NPHS2Q9NP85 383 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD5-211ENST00000545279 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms