RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 CRTC3Q6UUV7 619 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 DDHD1Q8NEL9 900 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAPK15Q8TD08 544 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC74AQ96AQ1 378 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 ASB8Q9H765 288 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 KCND1Q9NSA2 647 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 KCNK6Q9Y257 313 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 MROH6A6NGR9 719 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 PHF2O75151 1096 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 GAS8O95995 478 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 NFATC2Q13469 925 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRRTM4Q86VH4 590 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR6C4Q8NGE1 309 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 STYXQ8WUJ0 223 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC3Q9BQI4 270 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCG4Q9H172 646 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 RABGEF1Q9UJ41 708 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC78A2IDD5 438 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 H7C0S8 307 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 KMOO15229 486 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 ECEL1O95672 775 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 MT-CO3P00414 261 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 KRT14P02533 472 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 JUPP14923 745 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 MC4RP32245 332 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 VPS41P49754 854 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAZP56270 477 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 GTF2H3Q13889 308 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC38Q502W7 563 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDCP2Q5VXM1 449 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 MICALCLQ6ZW33 695 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF547Q8IVP9 402 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 NAGSQ8N159 534 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 PATE1Q8WXA2 126 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 TTC25Q96NG3 672 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 RANBP9Q96S59 729 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM96AQ9H5X1 160 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC23A2Q9UGH3 650 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CRLS1Q9UJA2 301 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 RNF215Q9Y6U7 377 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTAGE9A4FU28 777 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 AGAP14A8MT82 685 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CASC3O15234 703 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 FANCGO15287 622 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 EML2O95834 649 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 GLB1P16278 677 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 TPSB2P20231 275 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 ITGALP20701 1170 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADRA1DP25100 572 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 PSMA3P25788 255 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 FNTAP49354 379 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPS1Q13098 491 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 TPSAB1Q15661 275 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 INSCQ1MX18 579 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 SNX20Q7Z614 316 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARL14Q8N4G2 192 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 GATA6Q92908 595 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 ULK4Q96C45 1275 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CAPZA3Q96KX2 299 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 KLC4Q9NSK0 619 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRIT1Q9P2V4 623 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 TBC1D29Q9UFV1 150 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CLCA2Q9UQC9 943 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 NEU2Q9Y3R4 380 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 SAR1BQ9Y6B6 198 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 HEATR9A2RTY3 570 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 PNLIPP16233 465 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 MSH3P20585 1137 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 AKT1P31749 480 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARSDP51689 593 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CLCNKAP51800 687 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTSCP53634 463 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 TERF1P54274 439 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 LAMB3Q13751 1172 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 KCNJ11Q14654 390 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 SKIDA1Q1XH10 827 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSTD2Q5T7W7 516 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM220Q6QAJ8 160 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 C11orf96Q7Z7L8 435 aa17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms