RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494570.1

KDM4C-211, Transcript of lysine demethylase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4C, Length 647 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4C-211ENST00000494570 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 NR6A1Q15406 480 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 CHRNA6Q15825 494 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 GKN2Q86XP6 184 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF547Q8IVP9 402 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 ARL10Q8N8L6 244 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 PRELID2Q8N945 189 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 TRIM58Q8NG06 486 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 PATE1Q8WXA2 126 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 GLYATL1Q969I3 302 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 CDH19Q9H159 772 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 UGT1A7Q9HAW7 530 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 UGT1A10Q9HAW8 530 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 UGT1A8Q9HAW9 530 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 VPS18Q9P253 973 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 SLC23A2Q9UGH3 650 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 PADI4Q9UM07 663 aa8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 A0A1W2PQM1 296 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 USP27XA6NNY8 438 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 LDB2O43679 373 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 NUAK1O60285 661 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 MTX2O75431 263 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 AP2A1O95782 977 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 MT-CO3P00414 261 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 FGGP02679 453 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 SLC4A1P02730 911 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 VSIG8P0DPA2 414 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 GRIA1P42261 906 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 MAZP56270 477 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 SNX1Q13596 522 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 PEX6Q13608 980 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 CCNG2Q16589 344 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 P3H1Q32P28 736 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 XKR5Q6UX68 686 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 NAGSQ8N159 534 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 MS4A14Q96JA4 679 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 ALS2CR12Q96Q35 445 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 VPS35Q96QK1 796 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 OR2M4Q96R27 311 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 OR2AG1Q9H205 316 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 HACD3Q9P035 362 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 GULP1Q9UBP9 304 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 APPL1Q9UKG1 709 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.12□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.11□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 PMS2P1A4D2B8 440 aa8.11□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 AGAP14A8MT82 685 aa8.11□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 B4DGG1 531 aa8.11□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 FANCGO15287 622 aa8.11□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 PPM1DO15297 605 aa8.11□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 GRID2O43424 1007 aa8.11□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 B4GAT1O43505 415 aa8.11□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 SGTAO43765 313 aa8.11□□□□□ -1.11
KDM4C-211ENST00000494570 CEP104O60308 925 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms