RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-205	ENST00000444916	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	IL26	Q9NPH9	171 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	PKP3	Q9Y446	797 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916		D6RAR5	112 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	CHUK	O15111	745 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	GRID2	O43424	1007 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	VEGFD	O43915	354 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	BRINP1	O60477	761 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ACP5	P13686	325 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	GDF10	P55107	478 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	OLIG2	Q13516	323 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	PARP6	Q2NL67	630 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	P3H1	Q32P28	736 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ARL14	Q8N4G2	192 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	PATE1	Q8WXA2	126 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	RTP4	Q96DX8	246 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ARL5A	Q9Y689	179 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	C2orf81	A6NN90	581 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	LIAS	O43766	372 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	MTX2	O75431	263 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	METTL18	O95568	372 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	MPO	P05164	745 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	LSS	P48449	732 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	GABRE	P78334	506 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	BIRC2	Q13490	618 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	NR1D2	Q14995	579 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	SMOX	Q9NWM0	555 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ZW10	O43264	779 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	CDK14	O94921	469 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	CRTAM	O95727	393 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ACTN2	P35609	894 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	GPR3	P46089	330 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	FASLG	P48023	281 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	B4GALNT1	Q00973	533 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ITGA9	Q13797	1035 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	SPARCL1	Q14515	664 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	SFRP1	Q8N474	314 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	GDAP1	Q8TB36	358 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	TMEM74	Q96NL1	305 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	SATB2	Q9UPW6	733 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP4-205	ENST00000444916	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SH3BP4-205	ENST00000444916		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SH3BP4-205	ENST00000444916		A6NCN8	305 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SH3BP4-205	ENST00000444916	KMO	O15229	486 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SH3BP4-205	ENST00000444916	PPM1D	O15297	605 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SH3BP4-205	ENST00000444916	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SH3BP4-205	ENST00000444916	GPR39	O43194	453 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SH3BP4-205	ENST00000444916	B4GAT1	O43505	415 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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