RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 IQCF5A8MTL0 148 aa21.27■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ESR1P03372 595 aa21.27■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF460Q14592 562 aa21.27■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 VPS26BQ4G0F5 336 aa21.27■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.27■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CNTD1Q8N815 330 aa21.27■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 FCRL5Q96RD9 977 aa21.27■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 S100A14Q9HCY8 104 aa21.27■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PPEF2O14830 753 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC28A2O43868 658 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 HIST1H2ABP04908 130 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 HIST1H2ACQ93077 130 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PER2O15055 1255 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 C8AP07357 584 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TCF4P15884 667 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CCNA2P20248 432 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PAX7P23759 505 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 MTX3Q5HYI7 312 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 GLYATQ6IB77 296 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 NAT8LQ8N9F0 302 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 OGNP20774 298 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PTGER3P43115 390 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CHRNA4P43681 627 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PRMT2P55345 433 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF44Q7L0R7 432 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 HEATR4Q86WZ0 1026 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 HEPHQ9BQS7 1158 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PIGVQ9NUD9 493 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CNTN3Q9P232 1028 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 UROSP10746 265 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 JAK1P23458 1154 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 DEF8Q6ZN54 512 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PGAM4Q8N0Y7 254 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ING5Q8WYH8 240 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SCLYQ96I15 445 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 FEM1CQ96JP0 617 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PHLPP1O60346 1717 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 NRP1O14786 923 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB14P61106 215 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CPNE9Q8IYJ1 553 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SLCO2A1Q92959 643 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 Q9Y3F1 56 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 LPCAT4Q643R3 524 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TCF25Q9BQ70 676 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 BCO2Q9BYV7 579 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TBX18O95935 607 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CCNYL3P0C7X3 344 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SF1Q15637 639 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RINLQ6ZS11 566 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SPPL2CQ8IUH8 684 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 MCMBPQ9BTE3 642 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 C3orf14Q9HBI5 128 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB23Q9ULC3 237 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 A8MUI8 341 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CCNDBP1O95273 360 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 BMP7P18075 431 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 IDSP22304 550 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC1A2P43004 574 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ASMTP46597 345 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 GTF2H2Q13888 395 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 C9IYK1 514 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXD13P35453 343 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 GJA9P57773 515 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ATAT1Q5SQI0 421 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 PARGQ86W56 976 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ADCY4Q8NFM4 1077 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 ERGIC3Q9Y282 383 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 TULP2O00295 520 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms