RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 CLRN2A0PK11 232 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ACKR2O00590 384 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 FGF4P08620 206 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 CES1P23141 567 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 DNAJB2P25686 324 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 DGCR6Q14129 220 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ZNF544Q6NX49 715 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 C7orf31Q8N865 590 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 DUSP21Q9H596 190 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SATB2Q9UPW6 733 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 KRT6AP02538 564 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 KRT6BP04259 564 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 LBPP18428 481 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 SCNN1AP37088 669 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 GRIK1P39086 918 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 MASP1P48740 699 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ST13P50502 369 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 EMX2Q04743 252 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 PCID2Q5JVF3 399 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 PNCKQ6P2M8 343 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 CNIH3Q8TBE1 160 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 TWIST2Q8WVJ9 160 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 TEX37Q96LM6 180 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 PCYT2Q99447 389 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ITM2CQ9NQX7 267 aa21.59■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 METTL15A6NJ78 407 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 PDZK1P1A8MUH7 402 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 HAT1O14929 419 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 EEDO75530 441 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 CNTN5O94779 1100 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ASNSP08243 561 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 HGFP14210 728 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 KCNC1P48547 511 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 CDH13P55290 713 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 IER5Q5VY09 327 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 FAM20CQ8IXL6 584 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 DTWD1Q8N5C7 304 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 NACC2Q96BF6 587 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 DEPDC7Q96QD5 511 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 GAD1Q99259 594 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 TUBB1Q9H4B7 451 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 EPS8L2Q9H6S3 715 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 TRHDEQ9UKU6 1024 aa21.58■■□□□ 1.05
OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 H0Y626 953 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 KATNA1O75449 491 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TRIM16O95361 564 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PSMB9P28065 219 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 IFNA8P32881 189 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 GGT5P36269 586 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 DIO3P55073 304 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FOXA1P55317 472 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SLC35A2P78381 396 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FADDQ13158 208 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NPTX1Q15818 432 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ITFG1Q8TB96 612 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 LRRC3Q9BY71 257 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ADPRHL2Q9NX46 363 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 BOLA1Q9Y3E2 137 aa21.58■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CENPXA8MT69 81 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PPP6CO00743 305 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CDK14O94921 469 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 BCAT1P54687 386 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CHRNB3Q05901 458 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ZFP69Q49AA0 526 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CES5AQ6NT32 575 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NLGN4XQ8N0W4 816 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TUBGCP3Q96CW5 907 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FZD8Q9H461 694 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 POLG2Q9UHN1 485 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PRKD3O94806 890 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms