RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD207Q9UJ71 328 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 VSIG4Q9Y279 399 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLHL20Q9Y2M5 609 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 H0Y3Z8 333 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLK4O00444 970 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEPT4O43236 478 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPINT2O43291 252 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 WISP2O76076 250 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MLYCDO95822 493 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 HPRP00739 348 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV4-59P01825 116 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 NR2F2P24468 414 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLDN20P56880 219 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHRNDQ07001 517 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXM1Q08050 763 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 GOLGA8FQ08AF8 430 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CALCOCO2Q13137 446 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 LY6DQ14210 128 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTK2BQ14289 1009 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TEAD2Q15562 447 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTPROQ16827 1216 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 GFOD2Q3B7J2 385 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF766Q5HY98 468 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 VITQ6UXI7 678 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PACS1Q6VY07 963 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q6ZRP5 223 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 RINLQ6ZS11 566 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q75L30 129 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPP9Q86TI2 863 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR180Q86V85 440 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM160B2Q86V87 743 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 BEST3Q8N1M1 668 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPXM2Q8N436 756 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB42Q8N4Z0 105 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCLK2Q8N568 766 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 C11orf42Q8N5U0 333 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2C3Q8N628 320 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB2Q8N680 514 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 HUS1BQ8NHY5 278 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC17Q96AE7 1141 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM143Q96AN5 459 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CENPTQ96BT3 561 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC47A1Q96FL8 570 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGED4Q96JG8 741 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 B3GALT6Q96L58 329 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLX1AQ9BQ83 275 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 WWTR1Q9GZV5 400 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRMDAQ9H2I8 198 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 NDST4Q9H3R1 872 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC32A1Q9H598 525 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPHX3Q9H6B9 360 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOD2Q9HC29 1040 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 G6PC2Q9NQR9 355 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 DACT1Q9NYF0 836 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTTG2Q9NZH5 202 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLHL9Q9P2J3 617 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXL2Q9UKC9 423 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 IKZF3Q9UKT9 509 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 HIVEP2P31629 2446 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PP11 408 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 C17orf51A8MQB3 221 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 LGALS16A8MUM7 142 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TEX22C9J3V5 150 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 E7EVH7 732 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PER2O15055 1255 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRAK2O43187 625 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSPAN6O43657 245 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPRIN2O60269 458 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 NBNO60934 754 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 NXPH2O95156 264 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSPG5O95196 566 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIK3R1P27986 724 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHMT1P34896 483 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MMP12P39900 470 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 HALP42357 657 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAPK9P45984 424 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TM4SF4P48230 202 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms