RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292393.9

ZNF3-201, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF3, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-201ENST00000292393 CAB39LQ9H9S4 337 aa12□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 LATS2Q9NRM7 1088 aa12□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TAS2R13Q9NYV9 303 aa12□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 KLHL42Q9P2K6 505 aa12□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 EBF1Q9UH73 591 aa12□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 DCDC2Q9UHG0 476 aa12□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TLK1Q9UKI8 766 aa12□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 COQ6Q9Y2Z9 468 aa12□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TBC1D3EA0A087X179 549 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TMEM120BA0PK00 339 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 CCDC189A1A4V9 331 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TBC1D3LB9A6J9 549 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 VPS26AO75436 327 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TBC1D3HP0C7X1 549 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 FMO4P31512 558 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TRIM23P36406 574 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 NUDT1P36639 197 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 GPR1P46091 355 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 CCR3P51677 355 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 CDKN2DP55273 166 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 B4GALNT1Q00973 533 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 SGCGQ13326 291 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 LRRC14Q15048 493 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 CTSL3PQ5NE16 218 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 SEL1L3Q68CR1 1132 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 RAET1GQ6H3X3 334 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 ANO7Q6IWH7 933 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 UGT3A1Q6NUS8 523 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 PNCKQ6P2M8 343 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 RAPH1Q70E73 1250 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 CMC1Q7Z7K0 106 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 CEP97Q8IW35 865 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 PGBD3Q8N328 593 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 PNPLA1Q8N8W4 532 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 FLCNQ8NFG4 579 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 DCUN1D1Q96GG9 259 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 COX14Q96I36 57 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 NDNQ99608 321 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 OLFM1Q99784 485 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 SYTL2Q9HCH5 934 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 PCMTD2Q9NV79 361 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 MED16Q9Y2X0 877 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 ACOT9Q9Y305 439 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 A6NNZ2 444 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 GOLGA8RI6L899 631 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 STK25O00506 426 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 LATO43561 262 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 DCXO43602 365 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 VEGFDO43915 354 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 RHOBTB1O94844 696 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 SEMA4FO95754 770 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 GSTM1P09488 218 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 OR56A5P0C7T3 313 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 MSH3P20585 1137 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 HOXA6P31267 233 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 ACSL1P33121 698 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 CCR5P51681 352 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.494e-6■■■□□ 17.2
ZNF3-201ENST00000292393 GSTM4Q03013 218 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 MTAPQ13126 283 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 FGL2Q14314 439 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 WSCD2Q2TBF2 565 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TUBB8Q3ZCM7 444 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 CENPTQ96BT3 561 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 HIC2Q96JB3 615 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 UBXN10Q96LJ8 280 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 HHIPQ96QV1 700 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 PANX3Q96QZ0 392 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 SELENOSQ9BQE4 189 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 BOCQ9BWV1 1114 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TSSK1BQ9BXA7 367 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 TEX101Q9BY14 249 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF3-201ENST00000292393 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms