RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 KLC3Q6P597 504 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 IL17RCQ8NAC3 791 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR22Q99680 433 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A11Q9BYW1 496 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR41Q9HAD4 459 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 GMEB1Q9Y692 573 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GVM2 712 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 TCAF2A6NFQ2 919 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMD3O43242 534 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNMB4Q86W47 210 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS39Q96JC1 886 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 CIPCQ9C0C6 399 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPC5OSA6NMA1 111 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 DCLK1O15075 740 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF4P43489 277 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIA4P48058 902 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD11Q693B1 232 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 CHST9Q7L1S5 443 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 EFCAB3Q8N7B9 438 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAAF3Q8N9W5 541 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 GRID2O43424 1007 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM23O75077 832 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN3P26045 913 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 CSKP41240 450 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA3BQ13214 749 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 UGP2Q16851 508 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 NADK2Q4G0N4 442 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO43Q4G163 708 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf210Q8IVY1 113 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNPOQ8N3V7 929 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 RCN3Q96D15 328 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 GBA3Q9H227 469 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOVL2Q9NXB9 296 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 FRYLO94915 3013 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM38O00635 465 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGNO95427 931 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 MPSTP25325 297 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 MTA1Q13330 715 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC12A1Q13621 1099 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 CES3Q6UWW8 571 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 STYXQ8WUJ0 223 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM210AQ96ND0 272 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOJQ9H4E5 214 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP205Q92621 2012 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 F5H423 210 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 NPHS1O60500 1241 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6B1O95007 311 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPRE2Q15555 327 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 SPEM1Q8N4L4 309 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPC4APQ8TEL6 797 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0D9SEW6 157 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ACOT8O14734 319 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH4P55283 916 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 MYBPC1Q00872 1141 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 IRF9Q00978 393 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CEACAM7Q14002 265 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM92Q6UXU6 159 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS33Q8NF86 280 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB9Q96DX5 294 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ALG14Q96F25 216 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 FAR2Q96K12 515 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 AGAP2Q99490 1192 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ZYG11BQ9C0D3 744 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN11O75508 207 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00523Q86TU6 105 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF366Q8N895 744 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CNBD2Q96M20 576 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHA3P29320 983 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 PXNP49023 591 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
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