RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 St14P56677 855 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mat2aQ3THS6 395 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pomgnt2Q8BW41 605 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lacc1Q8BZT9 430 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wnt9aQ8R5M2 365 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zdhhc12Q8VC90 267 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atg13Q91YI1 516 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Det1Q9D0A0 550 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Numa1E9Q7G0 2094 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc74aE9Q9U8 364 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfy2P20662 777 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klrb1cP27814 223 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gjb3P28231 270 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tead2P48301 445 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tubgcp3P58854 905 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Htr4P97288 388 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc24a2Q14BI1 711 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nxpe4Q52KP5 543 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PdgfrlQ6PE55 375 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Smoc1Q8BLY1 463 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp398Q8BV16 643 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mark4Q8CIP4 752 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mcoln2Q8K595 566 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nsmce2Q91VT1 247 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mrps2Q924T2 291 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ifi44lQ9BDB7 447 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rprd1bQ9CSU0 326 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mrpl46Q9EQI8 283 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mkrn2Q9ERV1 416 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Padi4Q9Z183 666 aa8.91□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Taf1Q80UV9 1891 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 BC025446A0A087WQT1 134 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fibcd1A2AV25 459 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm10477F6SW83 55 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnase1l3O55070 310 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bmp4P21275 408 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ctps1P70698 591 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnal1Q05A62 190 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hyal5Q812F3 526 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klhl38Q8BSF5 581 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Syde1Q9DBZ9 737 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc4a11A2AJN7 862 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam155bA2BDP1 471 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mtx3D3YTP3 312 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp558E9Q1J0 407 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm7971J3QMM8 481 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CkmP07310 381 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc10a3P21129 473 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tlx1P43345 332 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sult1e1P49891 295 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zbtb48Q1H9T6 681 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 H2-M3Q31093 336 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pag1Q3U1F9 429 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttc9Q3V038 219 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Six1Q62231 284 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nemp1Q6ZQE4 437 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gabra5Q8BHJ7 463 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4931406P16RikQ8C5X1 1059 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mtg1Q8R2R6 326 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vps39Q8R5L3 886 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdhb13Q91Y06 796 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mau2Q9D2X5 619 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 LrgukQ9D5S7 820 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 H2bfmQ9DAB5 224 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Smim23Q9DAL0 136 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krt81Q9ERE2 481 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slfn2Q9Z0I6 378 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ros1Q78DX7 2340 aa8.9□□□□□ -0.98
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ssxb9A2BI93 185 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ZxdbA2CE44 873 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zc3h12bG3X9I7 835 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stfa3P35173 103 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nr2c2P49117 596 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prss55Q14BX2 321 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgef9Q3UTH8 516 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MyorgQ69ZQ1 716 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf821Q6PD05 413 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxo30Q8BJL1 746 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc32Q8BS39 179 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PigwQ8C398 503 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Traf3ip2Q8N7N6 555 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vopp1Q8R1C3 172 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppp1r14cQ8R4S0 164 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NepnQ9CQ76 512 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PirQ9D711 290 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ddi1Q9DAF3 408 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tdrd6P61407 2134 aa8.9□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spata31d1aE9QA35 1336 aa8.89□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc120A2AEV7 629 aa8.89□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lipo2D3YY49 398 aa8.89□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm16427J3QN52 483 aa8.89□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ikzf3O08900 507 aa8.89□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sh3pxd2aO89032 1124 aa8.89□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc45a4Q0P5V9 785 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.6 ms