RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pik3cgQ9JHG7 1102 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc25a14Q9Z2B2 325 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm3173A6NAS3 172 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pnldc1B2RXZ1 531 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zfp277E9Q6D6 583 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 NagluO88325 739 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mtnd3P03899 115 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PpargP37238 505 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hspa9P38647 679 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scg3P47867 471 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ypel5P62700 121 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ldb1P70662 411 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Anxa4P97429 319 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Acsbg2Q2XU92 667 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Msto1Q2YDW2 556 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Birc2Q62210 612 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sf1Q64213 653 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ubfd1Q78JW9 368 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Q80WR5 230 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cep57Q8CEE0 500 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rab43Q8CG50 210 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tgif2lx2Q8K5B9 231 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Phf10Q9D8M7 497 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tm9sf3Q9ET30 587 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tssc4Q9JHE7 317 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ap4b1Q9WV76 738 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mcf2A2AEU1 1111 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Grin3aA2AIR5 1135 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Il3P01586 166 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 P01668 110 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 FurinP23188 793 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Clec4fP70194 548 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Aars2Q14CH7 980 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trcg1Q58Y74 825 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fut10Q5F2L2 481 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Abcd2Q61285 741 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sh3gl3Q62421 347 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cntn4Q69Z26 1026 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 GnasQ6R0H7 1133 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pcdh19Q80TF3 1145 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cox15Q8BJ03 413 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 HhatQ8BMT9 499 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Krt222Q8CCX5 294 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 SuoxQ8R086 546 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc22a6Q8VC69 545 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Erlin1Q91X78 346 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pcdha6Q91Y14 946 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Atad3Q925I1 591 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sp2Q9D2H6 612 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tmem196V9GX04 182 aa18.46■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Actl10A2AKE7 346 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm1110F6Y113 635 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Colca2F8VPY8 239 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zfp871G5E905 615 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Crabp2P22935 138 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tcea3P23881 347 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sstr4P49660 385 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cav1P49817 178 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tbx4P70325 552 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pfdn6Q03958 127 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 StimateQ3UF25 288 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1810049J17RikQ3V2G9 153 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prkaa1Q5EG47 559 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Brsk2Q69Z98 735 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr845Q7TRG2 312 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr533Q7TRT7 320 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ap4e1Q80V94 1122 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pknox2Q8BG99 474 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cnpy4Q8BQ47 245 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rnf219Q8K2Y0 722 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Smyd2Q8R5A0 433 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cops8Q8VBV7 209 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr615Q8VGY4 313 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vps33aQ9D2N9 598 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nxnl2Q9D531 156 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Marveld3Q9D956 376 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Smad9Q9JIW5 430 aa18.45■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dock6Q8VDR9 2080 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr1188A2AV10 312 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vmn1r76F8VQ63 324 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Il4i1O09046 630 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pias1O88907 651 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Asgr1P34927 284 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rab23P35288 237 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pim3P58750 326 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hoxc4Q08624 264 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prss48Q14B25 312 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ccdc127Q3TC33 260 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 SbplQ3TUY3 232 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Apcdd1Q3U128 514 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppp1r7Q3UM45 361 aa18.44■□□□□ 0.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rnf223Q3UV31 285 aa18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.8 ms