RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 EFHD1Q9BUP0 239 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 ISCUQ9H1K1 167 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 ARFGAP3Q9NP61 516 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 PRDM8Q9NQV8 689 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 AIPL1Q9NZN9 384 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 OGFRQ9NZT2 677 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 CPNE7Q9UBL6 633 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 TTLL3Q9Y4R7 772 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 KCNMB2Q9Y691 235 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 ITPR2Q14571 2701 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-220ENST00000597474 CELSR2Q9HCU4 2923 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 MTSS1O43312 755 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 ANKRD34CP0C6C1 535 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 SPINT3P49223 89 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 KLHL30Q0D2K2 578 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 GALNT2Q10471 571 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 SASS6Q6UVJ0 657 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 SLC9B2Q86UD5 537 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 ESX1Q8N693 406 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 LPCAT1Q8NF37 534 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 MIB2Q96AX9 1013 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 SH3KBP1Q96B97 665 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 TRIM11Q96F44 468 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 LYSMD1Q96S90 227 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 ULBP3Q9BZM4 244 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 ATXN10Q9UBB4 475 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 ADGRG1Q9Y653 693 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 CREBBPQ92793 2442 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 A0A0G2JNG1 304 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 LILRA5A6NI73 299 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 KIR2DS3K7RE56 304 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 MATN3O15232 486 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 GRID2O43424 1007 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 NUAK1O60285 661 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 C9P02748 559 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 HLA-DQB2P05538 268 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 MYBL1P10243 752 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 TYRP1P17643 537 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 DLSTP36957 453 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 ARSEP51690 589 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 SH3BP2P78314 561 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 MC1RQ01726 317 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 FOXM1Q08050 763 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 KLRB1Q12918 225 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 MAP7Q14244 749 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 KRT81Q14533 505 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 KIR2DS5Q14953 304 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 FAM182AQ5T1J6 154 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 CLEC17AQ6ZS10 378 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 TMEM135Q86UB9 458 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 CPNE8Q86YQ8 564 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 PLXDC1Q8IUK5 500 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 LRRC49Q8IUZ0 686 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 FAM26EQ8N5C1 309 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 NIPA2Q8N8Q9 360 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 GALNT6Q8NCL4 622 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 FAM71BQ8TC56 605 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 EID2BQ96D98 161 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 C9orf72Q96LT7 481 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 CARD9Q9H257 536 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 FAM83DQ9H4H8 585 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 RMI1Q9H9A7 625 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 PCDH9Q9HC56 1237 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 37
FCHO1-220ENST00000597474 DTLQ9NZJ0 730 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 CROTQ9UKG9 612 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 DNPEPQ9ULA0 475 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 KCTD3Q9Y597 815 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 SPTBP11277 2137 aa12.82□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 BLACEA4D250 179 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 MMP2P08253 660 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 SLC2A4P14672 509 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 CD97P48960 835 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 SEPHS1P49903 392 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF165P49910 485 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 MLLT10P55197 1068 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 RPL26P61254 145 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 SEPT6Q14141 434 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 ERV3-1Q14264 604 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 ESPL1Q14674 2120 aa12.81□□□□□ -0.36
FCHO1-220ENST00000597474 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms