RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584051.1

CPD-208, Transcript of carboxypeptidase D, human

TSL 5

Gene CPD, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPD-208	ENST00000584051	IL18RAP	O95256	599 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	SFTPC	P11686	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	GP1BB	P13224	206 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	BRAF	P15056	766 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ITGAL	P20701	1170 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ABCB4	P21439	1286 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	AVPR1B	P47901	424 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	SLC11A2	P49281	568 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	TUB	P50607	506 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	TPMT	P51580	245 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	UCP3	P55916	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	C21orf59	P57076	290 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	E2F1	Q01094	437 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	MAPK7	Q13164	816 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	CTBP1	Q13363	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	IQCB1	Q15051	598 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	CNGA2	Q16280	664 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	LNX2	Q8N448	690 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	APIP	Q96GX9	242 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051		Q96MF0	132 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	LRBA	P50851	2863 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051		A0A087WWL8	130 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051		E9PMD0	336 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	VILL	O15195	856 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	KLK10	O43240	276 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	TIMM44	O43615	452 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	CACNG3	O60359	315 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	HKR1	P10072	659 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	BDNF	P23560	247 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	CD27	P26842	260 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ACADVL	P49748	655 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	BCAT1	P54687	386 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ASIC1	P78348	528 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	RBP5	P82980	135 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	FMO1	Q01740	532 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	TAF10	Q12962	218 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	TUBB3	Q13509	450 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	RAB32	Q13637	225 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	LY6D	Q14210	128 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	POSTN	Q15063	836 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	FUT11	Q495W5	492 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051		Q6YL49	198 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	TMEM25	Q86YD3	366 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPD-208	ENST00000584051	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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