RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582717.5

GGA3-214, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-214	ENST00000582717	CTBP1	Q13363	440 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	SEPT6	Q14141	434 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ATP6AP1	Q15904	470 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	LAYN	Q6UX15	382 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	SPRED1	Q7Z699	444 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	PGBD5	Q8N414	524 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	COG8	Q96MW5	612 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	TREX1	Q9NSU2	369 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ZNF711	Q9Y462	761 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	RAMP2	O60895	175 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	RASAL1	O95294	804 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	GNAO1	P09471	354 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	TACR2	P21452	398 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	OR1D2	P34982	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	SLC1A2	P43004	574 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	PHEX	P78562	749 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	MUC13	Q9H3R2	512 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	NEMP2	A6NFY4	417 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	TTC36	A6NLP5	189 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	SNAP91	O60641	907 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ATE1	O95260	518 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	GPI	P06744	558 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	SLC6A4	P31645	630 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ETFB	P38117	255 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	C21orf59	P57076	290 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	CWH43	Q9H720	699 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	AURKC	Q9UQB9	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	CLOCK	O15516	846 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	GJB3	O75712	270 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	GJB5	O95377	273 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ESRRB	O95718	433 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	INHBB	P09529	407 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	GPX3	P22352	226 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	OR1E1	P30953	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	CCT8	P50990	548 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	CLCN5	P51795	746 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	FOXM1	Q08050	763 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	SERINC3	Q13530	473 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	CSHL1	Q14406	222 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	RAB39A	Q14964	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	MOG	Q16653	247 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	LGI2	Q8N0V4	545 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	NME4	O00746	187 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	SUPT3H	O75486	399 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	SEC24A	O95486	1093 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	CAPG	P40121	348 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	TNK2	Q07912	1038 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	IL10RB	Q08334	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	PMS2P3	Q13401	168 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ACAP2	Q15057	778 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	PARP15	Q460N3	678 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-214	ENST00000582717	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		13.55	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms