RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	AGT	P01019	485 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	GLB1	P16278	677 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CTBS	Q01459	385 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TCEA2	Q15560	299 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	PERM1	Q5SV97	790 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	DOK6	Q6PKX4	331 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	GLYATL1	Q969I3	302 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	VPS35	Q96QK1	796 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	FICD	Q9BVA6	458 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	APPL1	Q9UKG1	709 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	LIAS	O43766	372 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	NUAK1	O60285	661 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ASMTL	O95671	621 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC4A1	P02730	911 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ITPKB	P27987	946 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CLDN6	P56747	220 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	RTP5	Q14D33	572 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	P3H1	Q32P28	736 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ALS2CL	Q60I27	953 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	IL26	Q9NPH9	171 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	PKP3	Q9Y446	797 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501		B4DGG1	531 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSMD3	O43242	534 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	VEGFD	O43915	354 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPAM1	P38567	509 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	GDF10	P55107	478 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDE1B	Q01064	536 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CFHR1	Q03591	330 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	C2orf81	A6NN90	581 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHUK	O15111	745 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	GRID2	O43424	1007 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	METTL18	O95568	372 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CRTAM	O95727	393 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACTR1B	P42025	376 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CLCNKA	P51800	687 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACTR1A	P61163	376 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	NR1D2	Q14995	579 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCNG2	Q16589	344 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ISX	Q2M1V0	245 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR2AG1	Q9H205	316 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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