RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	SNPH	O15079	494 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	VPS4B	O75351	444 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	AGFG2	O95081	481 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	PDGFA	P04085	211 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC172	P0C7W6	258 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	ACP5	P13686	325 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	GNLY	P22749	145 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	IL1R2	P27930	398 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	ARL4A	P40617	200 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	CLCNKA	P51800	687 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	GFER	P55789	205 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	IHH	Q14623	411 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	IL11RA	Q14626	422 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	FHL5	Q5TD97	284 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	TEX26	Q8N6G2	289 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	FANCL	Q9NW38	375 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	KCND3	Q9UK17	655 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	VPS4A	Q9UN37	437 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	CDC14C	A4D256	554 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	NUAK1	O60285	661 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	SNX2	O60749	519 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	KATNA1	O75449	491 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	CREG1	O75629	220 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	CLDN7	O95471	211 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	PRL	P01236	227 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	PCK1	P35558	622 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	SH3BP2	P78314	561 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	RNF31	Q96EP0	1072 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	OR6C1	Q96RD1	312 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	LYSMD1	Q96S90	227 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	PIPSL	A2A3N6	862 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	TTLL8	A6PVC2	850 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	GRID2	O43424	1007 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	KIAA0754	O94854	1291 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	NDUFA10	O95299	355 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	FGF5	P12034	268 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	SPINT3	P49223	89 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	SEPHS1	P49903	392 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	EPHB1	P54762	984 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	UBXN1	Q04323	297 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	SEMA5A	Q13591	1074 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	DNASE1L3	Q13609	305 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	BOLA3	Q53S33	107 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	CARD9	Q9H257	536 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	PADI1	Q9ULC6	663 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	CHKB	Q9Y259	395 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	SEMA7A	O75326	666 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	SPAG6	O75602	509 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	DNAJB5	O75953	348 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	UBXN7	O94888	489 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	RNF224	P0DH78	156 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	RARA	P10276	462 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-238	ENST00000568169	GZMA	P12544	262 aa		11.22	□□□□□ -0.61

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